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Enregistrement W2906080559 · doi:10.14785/lymphosign-2018-0015

A novel homozygous mutation in CIITA resulting in MHC Class II deficiency in an adult patient

2018· article· en· W2906080559 sur OpenAlexaffvenue
Jane Hsieh, Amarilla B. Mandola, Stephen Betschel

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCIITAMHC class IIImmunologyMajor histocompatibility complexMHC class IPrimary immunodeficiencyLeukocyte adhesion deficiencyBiologyImmune dysregulationHuman leukocyte antigenCD8Immune systemMedicineAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Major histocompatibility (MHC) class II deficiency is a rare autosomal recessive primary immunodeficiency with fewer than 200 patients reported worldwide. Patients usually present within their first year of life with severe and recurrent infections, failure to thrive, and chronic diarrhea. The disorder is caused by absent or reduced MHC class II expression on cell surfaces, leading to defective cellular and humoral immune responses. The disease is associated with a poor prognosis, with most patients dying in early childhood due to infectious complications. Aim: To report the clinical, immunological, and genetic features of an adult patient with MHC class II deficiency who did not undergo hematopoietic stem cell transplant (HSCT). We also explore proposed theories as to why some patients with MHC class II deficiency survive to adulthood, beyond the typical life expectancy. Results: We present a 23-year-old gentleman who was diagnosed with MHC class II deficiency at the age of 6 months based on a near complete absence of Human Leukocyte Antigen - DR isotype on peripheral blood mononuclear cells and CD4+ lymphopenia. He is one of a few patients with the condition reported in the literature to have survived to adulthood despite not having undergone HSCT. Next generation sequencing revealed a novel homozygous mutation in the CIITA gene, 1 of 4 genes involved in the regulation of MHC class II transcription. Discussion: MHC class II deficiency is considered a single entity phenotypic condition where the main problem lies in reduced or absent MHC class II expression and results in downstream immunologic effects, including CD4+ lymphopenia and impaired antigen specific responses. However, phenotypic differences between patients are emerging as more cases are described in the literature. Our patient, now 23 years old, has survived significantly beyond life expectancy despite not having HSCT. Statement of novelty: We describe a case of an adult patient diagnosed with MHC class II deficiency due to a novel homozygous intronic splice site variant in the CIITA gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,651
Score d'incertitude au seuil0,828

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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