MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2906103013 · doi:10.1080/10408363.2018.1519522

Diurnal rhythm in clinical chemistry: An underrated source of variation

2018· review· en· W2906103013 sur OpenAlexaff
Mohamed Abou El Hassan, Edgard Delvin, Manal O. Elnenaei, Barry Hoffman

Notice bibliographique

RevueCritical Reviews in Clinical Laboratory Sciences · 2018
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClinical Laboratory Practices and Quality Control
Établissements canadiensMount Sinai HospitalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineQueen Elizabeth II Health Sciences CentreUniversité de MontréalNova Scotia Health AuthorityUniversity of TorontoDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiurnal temperature variationAnalyteCircadian rhythmMetric (unit)ChemistryEnvironmental scienceAtmospheric sciencesBiologyChromatographyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diurnal rhythm complicates the acquisition of clinical laboratory samples by adding a predictable time-dependent component to the pre-analytical variation that, if not taken into account, degrades the clinical utility of results on certain analytes. Here we performed a systematic review of the literature and identified, in 56 publications that met our minimum inclusion criteria, 30 analytes that undergo diurnal variation. We graded the quality of evidence of these publications using a 3-tier scoring system of our own formulation. The rigor of the experimental design and agreement varied considerably across studies. Analyte concentration oscillated considerably over the 24-h day–night cycle. The median zenith-to-nadir change relative to the nadir concentration (%ZNC) for the 30 analytes was 100%. To set the magnitude of diurnal variation into perspective, we assessed the fluctuation in analyte concentration throughout the 24-h period (diurnal variation (%CVdv)) relative to the day-to-day fluctuation determined at a fixed time during the 24-h period (within-subject biological variation (%CVw)). Then we divided the %CVdv by the published %CVw to obtain a novel metric termed the diurnal variation index (DVI). The median DVI for the 16 analytes examined was 2.0, underscoring that, for most analytes, the diurnal variation was larger than the published %CVw and highlighting the importance of adhering to protocols regulating the time of sampling when dealing with these analytes. Given that the %CVw is the basis of the reference change value (RCV) and several quality metrics such as the Sigma metric (based on total allowable error), failure to regulate the time of sample collection will compromise these %CVw-based targets. We also provide examples where failure to regulate the time of collection of diurnally changing analytes compromises their diagnostic utility. Nevertheless, for the most part, websites of major laboratories in the USA and Europe do not consistently stipulate collection at specified time junctures for the majority of the analytes identified here.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,090
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,165
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,478

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0900,165
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0050,007
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,391
Tête enseignante GPT0,589
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCritical Reviews in Clinical Laboratory SciencesMême sujetClinical Laboratory Practices and Quality ControlTravaux en français237 207