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Enregistrement W2906108672 · doi:10.3390/ecmc-4-05626

p<em>K</em><sub>a</sub> modulation of a bis(2-aminoimidazoline) DNA minor groove binder that targets the kinetoplast of <em>Trypanosoma brucei</em>

2018· article· en· W2906108672 sur OpenAlexaff
J. Jonathan Nué-Martínez, Cinthia Millán, Godwin U. Ebiloma, Harry J. de Koning, J. Lourdes Campos, Christophe Dardonville

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrypanosoma species research and implications
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMinor groovePhysicsDNAMolecular biologyBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The parasite Trypanosoma brucei, ethiologic agent of human African trypanosomiasis (i.e. sleeping sickness), contains a kinetoplast with the mitochondrial DNA (kDNA) comprising of >70 % AT base pairs. Hence, DNA minor groove binding molecules have been investigated as antitrypanosomal agents. Diphenyl-based bis(2-iminoimidazolidines) are promising DNA minor groove binders that are curative in mouse models of stage 1 trypanosomiasis but devoid of activity in the late(CNS)-stage disease, possibly due to poor brain penetration caused by their dicationic nature. As a strategy to reduce the pKa of the basic 2-iminoimidazolidine groups, halogen atoms (R1 = Cl, F) were introduced in the structure of lead compound 1 and the pKa of the new compounds was determined . A reduction of 1–2 pKa units for the imidazolidine group linked to the substituted phenyl ring was observed. In vitro activities (EC50) against wild type and resistant strains of T. b. brucei were in the submicromolar range with four compounds being more active and selective than 1 (SI > 340).1 The chloro-substituted derivative 5a, which was curative in vivo in a mouse model of stage 1 infection by T. b. rhodesiense, appeared as a new promising lead compound.2 Mechanistic studies were performed to identify the cellular target of these dicationic compounds. Altogether, our results show that 1 and 5a share the same mechanism of action against T. brucei, acting specifically on the integrity of the kinetoplast by altering the structure and replication of kDNA.2

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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