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Enregistrement W2906161455 · doi:10.1186/s12870-018-1587-8

Interactive effects of multiple vernalization (Vrn-1)- and photoperiod (Ppd-1)-related genes on the growth habit of bread wheat and their association with heading and flowering time

2018· article· en· W2906161455 sur OpenAlexfundno aff
Shulin Chen, Junsen Wang, Genwang Deng, Long Chen, Xiyong Cheng, Haixia Xu, Kehui Zhan

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Key Research and Development Program of ChinaInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of Sciences
Mots-clésVernalizationBiologyphotoperiodismSowingCultivarAlleleHabitHeading (navigation)PopulationGrowing seasonGenotypeHorticultureWinter wheatGeneBotanyAgronomyAnimal scienceGeneticsDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The precise identification of Winterness/Springness (growth habit) for bread wheat, which is determined by genes involved in vernalization and photoperiod, will contribute to the effective utilization of bread wheat varieties. Here, 198 varieties from the Yellow and Huai wheat production region (YHW) in China were collected to identify their vernalization (Vrn-1) and photoperiod (Ppd-1) gene composition via a series of functional markers and their association with vernalization and photoperiod requirements at three locations during two years of experiments. The growth habits were measured during the spring sowing season. RESULTS: The results showed that the semi-winter varieties (grades1-4) were most prevalent in the population. The relative effects of single Vrn alleles on the growth period, such as heading date (HD) and/or flowering date (FD), were as follows: Vrn-B1b > Vrn-B1a > Vrn-D1b > Vrn-D1a > vrn-D1 = vrn-B1. The interactive effects of Vrn-B1 and Vrn-D1 on HD and FD were identical to those of Vrn-B1b. Approximately 35.3% of the cultivars carried Ppd-B1a (photoperiod-insensitive) and exhibited the earliest HD and FD. The Ppd-D1a-insensitive allele (Hapl II) was carried by just 0.5% of the varieties; however, the other two sensitive alleles were present at a higher frequency, and their effects were slightly weaker than those of Ppd-B1a. In addition, strong interactive effects between Ppd-B1 and Ppd-D1 were detected. In terms of mean values among various genotypes, the effects followed the order of Vrn-1 > Ppd-1. CONCLUSIONS: According to the results of ANOVA and least significant range (LSR) tests, we can conclude that Vrn-1 rather than Ppd-1 played a major role in controlling vernalization and photoperiod responses in this region. This research will be helpful for precisely characterizing and evaluating the HD, FD and even growth habit of varieties in the YHW at molecular levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil0,104

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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