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Enregistrement W2906422279

Intuitive Data-Driven Visualization of Food Relatedness via t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding

2018· article· en· W2906422279 sur OpenAlexvenueno aff
Kaylen J. Pfisterer, Robert Amelard, Alexander Wong

Notice bibliographique

RevueJournal of Computational Vision and Imaging Systems · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNutritional Studies and Diet
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceEmbeddingCluster analysisContext (archaeology)IntuitionVisualizationHeuristicData miningMachine learningArtificial intelligencePsychologyBiology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The relationship between diet and health is important, yet difficultto study in practice. Dietary pattern analysis is one method forinvestigating this link; having more variety in diet tends to be bene-ficial and a score can be generated based on a heuristic approachto food intake habits. We aim to enhance the intuition behindthese food scores by creating an intuitive data-driven visualizationof food relatedness by leveraging t-distributed stochastic neighborembedding (t-SNE). More specifically, by performing t-SNE anal-ysis in a controlled manner to project the high-dimensional nutri-tional information of food items into a lower dimensional food sim-ilarity space, the natural clustering of foods based on the underly-ing nutritional composition becomes visually observable. The effi-cacy of this data-driven approach for visualizing food relatednesswas investigated on a total of 8549 food item entries in the USDAfood composition database, with the results showing considerablepromise as a tool for gaining important nutritional insights. This isthe first step toward providing a novel method to enhance dietarypattern analysis with additional context and insight into food intakehabits based on the inherent nutritional content of the foods con-sumed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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