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Enregistrement W2906730072 · doi:10.14745/ccdr.v45i01a03

Invasive group A streptococcal infection outbreaks of type emm118 in a long-term care facility, and of type emm74 in the homeless population, Montréal, Quebec

2019· article· en· W2906730072 sur OpenAlexafffundvenueabout
PA Pilon, Nathalie Savard, Joséphine Aho, Jean Caron, A Urbanek, Renée Paré, P Le Guerrier, Claudia Savard, Karon Hammond-Collins, Christina Tran, R. W. Allard, MC Domingo

Notice bibliographique

RevueCanada Communicable Disease Report · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensSte. Anne's HospitalPublic Health Agency of CanadaMcGill UniversityUniversité de MontréalCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-Montréal
Organismes subventionnairesMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésOutbreakAsymptomatic carrierInfection controlAsymptomaticPopulationMedicinePublic healthEnvironmental healthNursingSurgeryVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Two invasive group A streptococcus (iGAS) infection outbreaks occurred in Montréal in 2016 and 2017; one in a long-term care facility (type emm118) and one in the community, primarily involving homeless people (type emm74).Objective: To describe two recent iGAS outbreaks in Montréal and highlight the challenges in dealing with these outbreaks and the need to tailor the public health response to control them.Methodology: All cases of iGAS were investigated and the isolates were sent to the laboratory for emm typing.In both outbreaks, cases of superficial group A streptococcus (GAS) infection were identified, through 1) systematic case detection accompanied by screening for asymptomatic carriers among residents and employees of the long-term care facility and 2) sentinel surveillance among homeless people.Visits were made to community organizations providing homeless services (including shelters) and social networks were analyzed to establish whether there were any links among cases of GAS infection (both invasive and noninvasive) and locations frequented.In both outbreaks, recommendations were made to service providers regarding enhancement of infection prevention and control measures.Results: In the long-term care facility, five cases of type emm118 iGAS were identified over a 22-month period, one of which resulted in death.All residents were screened and no carriers were identified.Among the employees, 81 (65%) were screened and four carriers were identified.Of those, one was a carrier of type emm118 GAS.All carriers were treated, and subsequent follow-up sampling on three carriers (including the one with emm118) was negative.In the community, 23 cases of type emm74 iGAS were detected over a 16-month period, four of which resulted in death.Half of the cases (n=12) were described as homeless, and six others were users of services for the homeless.Sentinel surveillance of superficial infections yielded 64 cultures with GAS, chiefly on the skin, including 51 (80%) of type emm74.An analysis of the social networks revealed the large number and variety of resources for the homeless used by the cases.Visits to the community organizations providing homeless services revealed the heterogeneity and precariousness of some of these services, the difficulties encountered in applying adequate health and hygiene measures, and the high degree of mobility amongst those who use these services.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,114

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2019
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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