MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2908061981 · doi:10.1002/jgc4.1074

Genetic counseling considerations with rapid genome‐wide sequencing in a neonatal intensive care unit

2018· article· en· W2908061981 sur OpenAlexafffund
Emma E. Smith, Christèle du Souich, Nick Dragojlovic

Notice bibliographique

RevueJournal of Genetic Counseling · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensCentre for Advancing Health OutcomesBC Children's HospitalWomen's Health Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversity of British ColumbiaProvincial Health Services AuthorityGenome British ColumbiaBC Children’s Hospital Foundation
Mots-clésGenetic counselingAnxietyNeonatal intensive care unitExome sequencingMedicinePopulationDepression (economics)Genetic testingMedical geneticsPsychiatryPediatricsFamily medicineGeneticsBiologyInternal medicineMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As genome-wide sequencing (GWS; exome sequencing [ES] and whole genome sequencing [WGS]) is implemented more frequently in the neonatal intensive care unit (NICU), it is important to understand parents' opinions regarding GWS, and views toward incidental findings (IFs) (also known as secondary findings). RAPIDOMICS was a pilot study of rapid trio-based (biological parents and neonate) ES for 25 neonates with a suspected genetic condition at the BC Women's Hospital NICU. As part of RAPIDOMICS, we explored parents' motivations and concerns regarding ES of their child, uptake of IFs for themselves, and rates of anxiety and depression at the time of pre-test genetic counseling via administration of the Generalized Anxiety Disorder Assessment 7 and Patient Health Questionnaire 8. These findings were compared to those from the Clinical Assessment of the Utility of Sequencing and Evaluation as a Service (CAUSES) study (outpatient trio-based GWS) that includes pediatric patients with suspected genetic disease (with an average age of 10 years). Parents in RAPIDOMICS were more likely to identify "diagnosis" as their primary motivation to pursue GWS (p = 0.011), less likely to identify "no concerns" (p = 0.003), and less likely to opt in to receive IFs (p = 0.003) than parents in CAUSES. Rates of depression and anxiety in both groups were higher relative to the general population. We present novel findings regarding the similarities and differences in parental opinions and decisions of these cohorts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,567
Score d'incertitude au seuil0,839

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Genetic CounselingMême sujetGenomics and Rare DiseasesTravaux en français237 207