MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2909038676 · doi:10.1097/pai.0000000000000726

Immunohistochemistry Use by Diagnostic Category and Pathologist in 4477 Prostate Core Biopsy Sets Assessed at Two Hospitals

2019· article· en· W2909038676 sur OpenAlexaff
Michael Bonert, Ihab El-Shinnawy, Mozibur Rahman, Pierre Major, Samih Salama, Bobby Shayegan, Jean‐Claude Cutz, Anil Kapoor

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcMaster UniversityHamilton Health SciencesSt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMalignancyImmunohistochemistryIntraepithelial neoplasiaBiopsyCancerProstate cancerProstatePathologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Immunohistochemistry (IHC) use in prostate cores is not routinely determined and its value assessed. METHODS: Pathology reports for cases accessioned 2011 to 2017 at two hospitals were retrieved. IHC orders by pathologist and hospital were extracted with a custom program and tabulated. The diagnostic category (and highest grade cancer if applicable) was obtained by a hierarchical (free text) string matching algorithm. RESULTS: The study period contained 4477 biopsy sets. Categorized by worst pathology (% stained), the cohort was: benign: 1184 cases (42%); prostatic intraepithelial neoplasia: 168 (68%); suspicious: 323 (93%); grade group 1 cancer (WHO1): 900 (78%); grade group two (WHO2): 840 (60%); WHO3 cancer: 451 (54%); WHO4 cancer: 363 (46%); WHO5 cancer: 215 (56%); cancer grade not specified: 33 (52%). The hospital was a predictor; site A(2716 biopsies) and site B(1761) accounted for 10,183 and 14,852 IHC, respectively. The cases with IHC decreased in the last 4 years (site A: 57->45%, site B: 79->73%). Thirty-five pathologists read >20 cases each and together interpreted 4418 (range, 21 to 415; median, 88). In total 24,766 IHCs were done on the 4,418 cases (5.6/case). The mean/median/SD/max/min IHCs/case for the 35 pathologists was 5.6/4.1/3.9/15.2/0.9. High IHC users (1st and 2nd quintile pathologists) called more suspicious for malignancy but not significantly more WHO1 than low IHC users. CONCLUSIONS: IHC use is most frequent at the benign/malignant interface, and dependent on the pathologist and hospital; however, it is independent of WHO1 cancer rate. Diagnostic rate information can inform and define appropriate and rational IHC use. We plan to follow IHC utilization retrospectively in relation to the diagnostic category going forward.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueApplied immunohistochemistry & molecular morphologyMême sujetProstate Cancer Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207