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Enregistrement W2909193231 · doi:10.25560/25763

The biology of novel dual histone methyltransferase inhibitors

2015· dissertation· en· W2909193231 sur OpenAlexfundno aff
Ian Green

Notice bibliographique

RevueSpiral (Imperial College London) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistero dello Sviluppo EconomicoEuropean CommissionImperial College LondonCancer Research UKOntario Ministry of Economic Development and InnovationOntario Genomics InstituteOntario GenomicsGenome CanadaWellcome TrustGlaxoSmithKlinePfizerOvarian Cancer ActionEngineering and Physical Sciences Research CouncilEli Lilly and Company
Mots-clésHistone methyltransferaseComputational biologyDual (grammatical number)BiologyHistoneGeneticsArtLiteratureDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: EZH2 is a histone methyltransferase (HKMT) responsible for the maintenance of epigenetic silencing of genes through maintenance of the repressive H3K27me3 mark and it is aberrantly regulated in numerous cancers, including breast cancer where it is linked to aggressive phenotypes and poor clinical outcomes. EHMT2 is a related HKMT responsible for gene silencing by mediating H3K9me3 levels. EHMT2 is also responsible for H3K27me1 and has been shown to physically interact with EZH2. Specific inhibitors of EZH2 are available and have been shown to be effective in cancers with EZH2 mutation driven phenotypes (e.g. follicular lymphoma) but have shown limited efficacy in epithelial cancers. Here we present the characterisation of novel dual HKMT inhibitors targeting both EZH2 and EHMT2, which we believe will have a greater impact than individual inhibitors in reversing EZH2 mediated silencing. Results: Utilising publicly available data, we show expression of EZH2 and related subunits of the PRC2 complex and related EHMT2/EHMT1 complex range greatly in normal tissue, but EZH2 and EHMT2 expression are consistently up-regulated in numerous cancers. We show that CNV and mutation of EZH2 and EHMT2 infrequently occur in breast cancer- however, in breast cancer high expression of EZH2 is linked to reduced RFS and OS of patients. In breast cancer cell lines, dual HKMT inhibitors up-regulate EZH2 target genes, in gene specific and genome wide manner, to a greater degree than EZH2 or EHMT2 inhibition alone and induce expression of genes associated with apoptotic pathways. This up-regulation of silenced genes occurs concurrently with a decrease in H3K27me3 and H3K9me3 levels on target genes. In breast cancer cells and ovarian cancer cells, dual HKMT inhibitors reduce cell clonogenicity, cancer stem cell activity, cancer stem cell self-renewal capacity, and sensitise cancer stem cells to Paclitaxel and Cisplatin treatment. Conclusions: Novel dual inhibitors of EZH2 and EHMT2 alter gene expression and inhibit cell growth and cancer stem cell activity in wild-type EZH2 tumour cells. These data support the further preclinical and clinical evaluation of such inhibitors in triple negative breast cancer and epithelial ovarian cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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