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Enregistrement W2909300422 · doi:10.1093/ilar/ily020

Pathology Study Design, Conduct, and Reporting to Achieve Rigor and Reproducibility in Translational Research Using Animal Models

2018· article· en· W2909300422 sur OpenAlexaff
Jeffrey I. Everitt, Piper M. Treuting, Cheryl L. Scudamore, Rani S. Sellers, Patricia V. Turner, Jerrold M. Ward, Caroline J. Zeiss

Notice bibliographique

RevueILAR Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal testing and alternatives
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranslational researchMedicinePreclinical researchConcordanceBest practiceAnimal modelQuality (philosophy)RigourClinical study designClinical trialPathologyHuman studiesMedical physicsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In translational research, animal models are an important tool to aid in decision-making when taking potential therapies into human clinical trials. Recently, there have been a number of papers that have suggested limited concordance of preclinical animal experiments with subsequent human clinical experience. Assessments of preclinical animal studies have led to concerns about the reproducibility of data and have highlighted the need for an emphasis on rigor and quality in the planning, conduct, analysis, and reporting of such studies. The incorporation of a wider role for the comparative pathologist using pathology best practices in the planning and conduct of animal model-based research is one way to increase the quality and reproducibility of data. The use of optimal design and planning of tissue collection, incorporation of pathology methods into written protocols, conduct of pathology procedures using accepted best practices, and the use of optimal pathology analysis and reporting methods enhance the quality of the data acquired from many types of preclinical animal models and studies. Many of these pathology practices are well established in the discipline of toxicologic pathology and have a proven and useful track record in enhancing the data from animal-based studies used in safety assessment of human therapeutics. Some of this experience can be adopted by the wider community of preclinical investigators to increase the reproducibility of animal study data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,725
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,656
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,275
Score d'incertitude au seuil0,339

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,7250,656
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,005
Bibliométrie0,0130,009
Études des sciences et des technologies0,0060,012
Communication savante0,0140,008
Science ouverte0,0070,007
Intégrité de la recherche0,0070,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,828
Tête enseignante GPT0,583
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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