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Enregistrement W2909324552 · doi:10.1002/eji.201847801

Soluble CD93 is an apoptotic cell opsonin recognized by α <sub>x</sub> β <sub>2</sub>

2019· article· en· W2909324552 sur OpenAlexafffund
Jack Blackburn, Darius H. C. Lau, Elaine Y. Liu, Jessica Ellins, Angela M. Vrieze, Emily N. Pawlak, Jimmy D. Dikeakos, Bryan Heit

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Immunology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchLung Health FoundationHealth Research Board
Mots-clésEfferocytosisBiologyPhagocytosisCell biologyApoptosisOpsoninCellReceptorMembrane glycoproteinsMacrophageMolecular biologyGlycoproteinBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Efferocytosis is essential for homeostasis and prevention of the inflammatory and autoimmune diseases resulting from apoptotic cell lysis. CD93 is a transmembrane glycoprotein previously implicated in efferocytosis, with mutations in CD93 predisposing patients to efferocytosis‐associated diseases. CD93 is a cell surface protein, which is proteolytically shed under inflammatory conditions, but it is unknown how CD93 mediates efferocytosis or whether its efferocytic activity is mediated by the soluble or membrane‐bound form. Herein, using cell lines and human monocytes and macrophages, we demonstrate that soluble CD93 (sCD93) potently opsonizes apoptotic cells but not a broad range of microorganisms, whereas membrane‐bound CD93 has no phagocytic, efferocytic, or tethering activity. Using mass spectrometry, we identified α x β 2 as the receptor that recognizes sCD93, and via deletion mutagenesis determined that sCD93 binds to apoptotic cells via its C‐type lectin‐like domain and to α x β 2 by its EGF‐like repeats. The bridging of apoptotic cells to α x β 2 markedly enhanced efferocytosis by macrophages and was abrogated by α x β 2 knockdown. Combined, these data elucidate the mechanism by which CD93 regulates efferocytosis and identifies a previously unreported opsonin‐receptor system utilized by phagocytes for the efferocytic clearance of apoptotic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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