MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2909408414 · doi:10.1111/mec.15006

Phylogeography, population genetics and distribution modelling reveal vulnerability of <i>Scirpus longii </i>(Cyperaceae) and the Atlantic Coastal Plain Flora to climate change

2019· article· en· W2909408414 sur OpenAlexafffund
Daniel Spalink, R. A. MacKay, Kenneth J. Sytsma

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBotany, Ecology, and Taxonomy Studies
Établissements canadiensMount Saint Vincent University
Organismes subventionnairesMount Saint Vincent UniversityTexas A and M UniversityNational Science Foundation
Mots-clésScirpusBiologyCyperaceaePhylogeographyEcologyClimate changeFlora (microbiology)Coastal plainPopulationBiological dispersalWetlandPhylogeneticsPaleontologyPoaceaeDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A proactive approach to conservation must be predictive, anticipating how habitats will change and which species are likely to decline or prosper. We use composite species distribution modelling to identify suitable habitats for 18 members of the North American Atlantic Coastal Plain Flora (ACPF) since the Last Glacial Maximum and project these into the future. We then use Scirpus longii (Cyperaceae), a globally imperiled ACPF sedge with many of the characteristics of extinction vulnerability, as a case study. We integrate phylogeographical and population genetic analyses and species distribution modelling to develop a broad view of its current condition and prognosis for conservation. We use genotyping-by-sequencing to characterize the genomes of 142 S. longii individuals from 20 populations distributed throughout its range (New Jersey to Nova Scotia). We measure the distribution of genetic diversity in the species and reconstruct its phylogeographical history using the snapp and rase models. Extant populations of S. longii originated from a single refugium south of the Laurentide ice sheet around 25 ka. The genetic diversity of S. longii is exceedingly low, populations exhibit little genetic structure and the species is slightly inbred. Projected climate scenarios indicate that nearly half of extant populations of S. longii will be exposed to unsuitable climate by 2070. Similar changes in suitable habitat will occur for many other northern ACPF species-centres of diversity will shift northward and Nova Scotia may become the last refuges for those species not extinguished.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,212

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular EcologyMême sujetBotany, Ecology, and Taxonomy StudiesTravaux en français237 207