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Enregistrement W2909432303 · doi:10.1155/2019/3273645

Inflammasome Genes’ Polymorphisms in Egyptian Chronic Hepatitis C Patients: Influence on Vulnerability to Infection and Response to Treatment

2019· article· en· W2909432303 sur OpenAlexaff
Shady Estfanous, Sahar A. Ali, Sameh Seif, Sameh H. Soror, Dalia H. Abdelaziz

Notice bibliographique

RevueMediators of Inflammation · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesScience and Technology Development Fund
Mots-clésGenotypeSingle-nucleotide polymorphismPyrin domainInflammasomeGenotypingImmunologyMedicineAlleleSNPAllele frequencyInterferonBiologyInternal medicineVirologyGastroenterologyInflammationGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic inflammation is a pivotal contributor to the liver damage mediated by hepatitis C virus (HCV). The NOD-like receptor, pyrin domain-containing 3 (NLRP3) inflammasome is activated by HCV in both hepatocytes and Kupffer cells. The aim of our study was to investigate the association of nine single-nucleotide polymorphisms in four inflammasome genes (NLRP3, CARD8, IL-1 β , and IL-18) with the susceptibility to HCV infection and outcome of interferon treatment in 201 Egyptian chronic hepatitis C patients and 95 healthy controls. The genotyping was conducted using TaqMan predesigned SNP assay. In the comparative analysis, the CC genotype of the NLRP3 rs1539019 was found to be associated with the lower risk to chronic HCV infection (OR: 0.33, 95% CI: 0.17-0.62). This association was also found for the CA genotype and the A allele of the NLRP3 rs35829419 (OR: 0.18 and 0.22, respectively), in addition to the GG genotype and G allele of IL-18 rs1946518 (OR: 0.55 and 0.61, respectively). In contrast, the AA genotype of the IL-1 β rs1143629 was significantly more frequent in HCV patients (OR: 1.7, 95% CI: 1-2.86). Notably, the frequency of the AA genotype of NLRP3 rs1539019 was significantly higher in patients with lack of response (NR) to the interferon treatment (OR: 1.95, 95% CI: 1-3.7). A similar association was found for both the CC genotype and C allele of the NLRP3 rs35829419 (OR: 2.78 and 2.73, respectively) and for the TT genotype and T allele of CARD8 rs2043211 (OR: 2.64 and 1.54, respectively). Yet, the IL-1 β (rs1143629, rs1143634) and IL-18 (rs187238, rs1946518) polymorphisms did not show any significant association with response to interferon treatment. In conclusion, this study reports, for the first time, the association of genetic variations in NLRP3 with hepatitis C susceptibility and response to treatment in Egyptian patients. However, further large-scale studies are recommended to confirm our findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,138
Score d'incertitude au seuil0,800

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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