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Enregistrement W2909607278 · doi:10.1016/j.ymgmr.2018.12.006

Congenital lactic acidosis, cerebral cysts and pulmonary hypertension in an infant with FOXRED1 related complex I deficiency

2019· article· en· W2909607278 sur OpenAlexafffund
Delia Apatean, Bojana Rakić, Catherine Brunel‐Guitton, Glenda Hendson, Renkui Bai, Michael A. Sargent, Pascal M. Lavoie, Millan S. Patel, Sylvia Stöckler‐Ipsiroglu

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics and Metabolism Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineB.C. Women's Hospital & Health CentreBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBC Children's Hospital
Mots-clésExome sequencingCompound heterozygosityLactic acidosisPulmonary hypertensionExomeMedicineBiologyPathologyGeneMutationGeneticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondrial complex I is encoded by 38 nuclear-encoded and 7 mitochondrial-encoded genes. FOXRED1 is one of the 13 additional nuclear genes known as assembly factors. So far, four patients have been described with complex I deficiency caused by autosomal recessive mutations in FOXRED1 . Here, we report the fifth patient with FOXRED1 related complex 1 deficiency presenting with prenatal onset of bilateral periventricular cysts, congenital lactic acidosis , and persistent life-limiting pulmonary hypertension. Whole exome sequencing identified a compound heterozygosity for a known pathogenic variant (c.612_615dupAGTG; p.A206SfsX15) (paternal) and a likely pathogenic variant (c.874G > A; p.Gly292Arg) (maternal). Deficiency of complex I was demonstrated by the absence of complex I on Blue Native Gel Electrophoresis and by a significantly reduced complex I enzyme activity in the patient's fibroblasts. Compared with the previous known FOXRED1 cases, unique clinical features observed in our patient include bilateral periventricular cysts and severe pulmonary hypertension. Whole exome sequencing was instrumental in recognizing the underlying gene defect in this patient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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