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Enregistrement W2909628217 · doi:10.1167/iovs.18-25861

Retinal Characterization of the Thy1-GCaMP3 Transgenic Mouse Line After Optic Nerve Transection

2019· article· en· W2909628217 sur OpenAlexafffund
Stephanie N. Blandford, Michele L. Hooper, Takeshi Yabana, Balwantray C. Chauhan, William H. Baldridge, Spring R. Farrell

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthorityDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRetinalOptic nerveOphthalmologyGenetically modified mouseTransgeneAnatomyBiologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: GCaMP3 is a genetically encoded calcium indicator for monitoring intracellular calcium dynamics. We characterized the expression pattern and functional properties of GCaMP3 in the Thy1-GCaMP3 transgenic mouse retina. Methods: To determine the specificity of GCaMP3 expression, Thy1-GCaMP3 (B6; CBA-Tg(Thy1-GCaMP3)6Gfng/J) retinas were processed for immunohistochemistry with anti-green fluorescent protein (anti-GFP, to enhance GCaMP3 fluorescence), anti-RBPMS (retinal ganglion cell [RGC]-specific marker), and antibodies against amacrine cell markers (ChAT, GABA, GAD67, syntaxin). Calcium imaging was used to characterize functional responses of GCaMP3-expressing (GCaMP+) cells by recording calcium transients evoked by superfusion of kainic acid (KA; 10, 50, or 100 μM). In a subset of animals, optic nerve transection (ONT) was performed 3, 5, or 7 days prior to calcium imaging. Results: GFP immunoreactivity colocalized with RBPMS but not amacrine cell markers in both ONT and non-ONT (control) groups. Calcium transients evoked by KA were reduced after ONT (50 μM KA; ΔF/F0 [SD]; control: 1.00 [0.67], day 3: 0.50 [0.35], day 5: 0.31 [0.28], day 7: 0.35 [0.36]; P < 0.05 versus control). There was also a decrease in the number of GCaMP3+ cells after ONT (cells/mm2 [SD]; control: 2198 [453], day 3: 2224 [643], day 5: 1383 [375], day 7: 913 [178]; P < 0.05). Furthermore, the proportion of GCaMP3+ cells that responded to KA decreased after ONT (50 μM KA, 97%, 54%, 47%, and 58%; control, 3, 5, and 7 days, respectively). Conclusions: Following ONT, functional RGC responses are lost prior to the loss of RGC somata, suggesting that anatomical markers of RGCs may underestimate the extent of RGC dysfunction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,191
Score d'incertitude au seuil0,524

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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