MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2909811185 · doi:10.1097/pai.0000000000000732

PTEN Loss in a Prostate Cancer Cohort From Jordan

2019· article· en· W2909811185 sur OpenAlexaff
Samir Al Bashir, Abdallah Alzoubi, Mahmoud A. Alfaqih, Khalid Kheirallah, Aya Smairat, Husam K. Haddad, Ahmad Al-Dwairy, Baha Aldeen Bani Fawwaz, Mazhar Salim Al Zoubi, Kiril Trpkov

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPTENProstate cancerOncologyMedicineCohortProstateCancerInternal medicineCancer researchBiologyApoptosisPI3K/AKT/mTOR pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Deletion of phosphatase and tensin homolog (PTEN) in prostate cancer has been associated with early biochemical recurrence, increased metastatic potential, and androgen independence. We evaluated the status of PTEN loss in a cohort of prostate cancer patients from Jordan. We investigated 71 patients with prostate cancer and 52 control subjects with benign prostatic hyperplasia (BPH). PTEN status was assessed by immunohistochemistry. PTEN mutations on exons 1, 2, 5, and 8 were also evaluated by polymerase chain reaction single-stranded conformation polymorphism (PCR-SSCP). We found PTEN loss in 42 of 71 (59.2%) evaluated prostate cancer cases by immunohistochemistry. In contrast, 51 of 52 BPH (98.1%) cases had an intact PTEN. In a subset of 24 prostate cancer cases evaluated by PCR-SSCP, we found PTEN mutations in 15 (62.5%) cases, whereas 22 (91.7%) of BPH controls lacked PTEN mutations. Exon 5 was the most frequently mutated exon (37.5%). Although the loss of PTEN was not significantly correlated with the Gleason Score (GS) or the World Health Organization (WHO)-International Society of Urological Pathology (ISUP) Grade Group (GG), we found higher frequency of PTEN loss (64%) in patients with GS≥4+3/GG≥3, compared with patients with GS≤3+4/GG≤2 (47.6%). In this first study to address the question of PTEN loss in a predominantly Arab population, we documented the frequency of PTEN loss in prostate cancer patients from Jordan, which was found to be higher than in comparable cohorts from East Asia, and was at the higher end of the range of reported frequency of PTEN loss in respective cohorts from North America and Western Europe. Although there was more frequent PTEN loss in cancers with higher GS/GG, this was not statistically significant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueApplied immunohistochemistry & molecular morphologyMême sujetProstate Cancer Treatment and ResearchTravaux en français237 207