Human papillomavirus DNA detected in fingertip, oral and bathroom samples from unvaccinated adolescent girls in Tanzania
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Human papillomavirus (HPV) DNA has been detected in vaginal samples from adolescent girls who report no previous sex and, in high-income settings, from fingertips, raising the possibility of non-sexual transmission. No such studies originate from East Africa which bears among the highest cervical cancer incidence and HPV prevalence worldwide. HPV-related oral cancer incidence is increasing, but oral HPV prevalence data from East Africa are limited. We aimed to describe the HPV DNA prevalence in genital and non-genital sites and in the bathroom of unvaccinated adolescent girls, and examine genotype concordance between sites. METHODS: We nested a cross-sectional study of HPV in genital and extragenital sites within a cohort study of vaginal HPV acquisition. Unvaccinated girls age 16-18 years in Tanzania, who reported ever having had sex, were consented, enrolled and tested for the presence of HPV DNA in vaginal samples collected using self-administered swabs, oral samples collected using an oral rinse, and on fingertips and bathroom surfaces collected using a cytobrush. RESULTS: Overall, 65 girls were enrolled and 23 (35%, 95% CI 23% to 47%) had detectable vaginal HPV. Adequate (β-globin positive) samples were collected from 36 girls' fingertips and HPV was detected in 7 (19%, 95% CI 6% to 33%). 63 girls provided adequate oral samples, 4 (6%, 95% CI 0% to 13%) of which had HPV DNA detected. In bathroom samples from 58 girls, 4 (7%, 95% CI 0% to 14%) had detectable HPV DNA. Of the 11 girls with extragenital HPV, six had the same genotype in >1 site. CONCLUSION: We found a high prevalence of HPV in non-genital sites in adolescent girls and in their bathrooms, in this region with a high cervical cancer incidence. Concordance of genotypes between sites supports the possibility of autoinoculation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».