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Enregistrement W2910115692 · doi:10.3389/fpls.2018.01867

Loss of Function of the E1-Like-b Gene Associates With Early Flowering Under Long-Day Conditions in Soybean

2019· article· en· W2910115692 sur OpenAlexfundaboutno aff
Jianghui Zhu, Ryoma Takeshima, Kohei Harigai, Meilan Xu, Fanjiang Kong, Baohui Liu, Akira Kanazawa, Tetsuya Yamada, Jun Abe

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceAgriculture and Agri-Food CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyAllelephotoperiodismLocus (genetics)GeneCultivarGeneticsLong dayDay lengthPhytochromeHorticultureBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Photoperiod response of flowering determines plant adaptation to different latitudes. Soybean, a short-day plant, has gained the ability to flower under long-day conditions during the growing season at higher latitudes, mainly through dysfunction of phytochrome A genes (E3 and E4) and the floral repressor E1. In this study, we identified a novel molecular genetic basis of photoperiod insensitivity in Far-eastern Russian soybean cultivars. By testcrossing these cultivars with a Canadian cultivar Harosoy near-isogenic line for a recessive e3 allele, followed by association tests and fine mapping, we determined that the insensitivity was inherited as a single recessive gene located in an 842-kb interval in the pericentromeric region of chromosome 4, where E1-Like b (E1Lb), a homoeologue of E1, is located. Sequencing analysis detected a single-nucleotide deletion in the coding sequence of insensitive cultivars, which generated a premature stop codon. Comparative analyses of near-isogenic lines indicated that the loss-of-function allele (designated e1lb) upregulated the expression of soybean FLOWERING LOCUS T (FT) orthologues, FT2a and FT5a, to promote flowering under long-day conditions in both the e3/E4 and E3/E4 genetic backgrounds. The e1lb allele completely canceled the inhibitory effect of far-red light–enriched long-day conditions, which is mediated by E4, but not that of red-light–enriched long-day conditions, which is mediated by E3. These findings suggest that E1Lb retards flowering under long-day conditions independently of E1 by repressing the expression of FT2a and FT5a. This loss-of-function allele can be used as a new resource in breeding of photoperiod-insensitive cultivars, and may improve our understanding of the function of the E1 family genes in the photoperiod responses of flowering in soybean.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,149
Score d'incertitude au seuil0,088

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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