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Enregistrement W2910189085 · doi:10.1158/1557-3265.sarcomas17-ia02

Abstract IA02: Modeling sarcoma susceptibility: The Li-Fraumeni syndrome paradigm

2018· article· en· W2910189085 sur OpenAlexaff
David Malkin

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLi–Fraumeni syndromeSarcomaCancerGermlineRhabdomyosarcomaMedicineGermline mutationMutationPhenotypeDiseaseGeneticsCancer researchBiologyGeneInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The original description of Li-Fraumeni syndrome (LFS) 1969 was generated from the ascertainment of medical and death records of over 600 children with rhabdomyosarcoma. Although the clinical definition of LFS has evolved over the decades, the occurrence of sarcoma in at least one affected TP53 gene mutation carrier is common to many families. However, the genotype:cancer phenotype association of sarcomas in mutation carriers remains poorly understood. This lecture will review some of the phenotypic characterizations of sarcomas in LFS and explore recent exciting advances that suggest a role for various genetic/genomic and epigenetic modifiers of the underlying germline TP53 mutation in defining these clinical phenotypes. The challenges and opportunities to enhance early tumor detection and modify disease risk will also be discussed. Citation Format: David Malkin. Modeling sarcoma susceptibility: The Li-Fraumeni syndrome paradigm [abstract]. In: Proceedings of the AACR Conference on Advances in Sarcomas: From Basic Science to Clinical Translation; May 16-19, 2017; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2018;24(2_Suppl):Abstract nr IA02.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,356
Tête enseignante GPT0,537
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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