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Enregistrement W2910491444 · doi:10.14202/vetworld.2019.79-84

Phylogenetic characterization of Salmonella enterica from pig production and humans in Thailand and Laos border provinces

2019· article· en· W2910491444 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueVeterinary World · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsThailand Research FundChulalongkorn University
Mots-clésSalmonella entericaPhylogenetic treeSalmonellaBiologyPhylogeneticsPhylogenetic relationshipGeographyVeterinary medicineGeneBacteriaGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background and Aim: The genetic relationship among serotypes of Salmonella enterica from food animals, food of animal origin, and human is of interest as the data could provide an important clue for the source of human infection. This study aimed to determine the genetic relatedness of S. enterica from pig production and human in Thailand-Laos border provinces. Materials and Methods: A total of 195 S. enterica serotypes isolated from pig and pork (n=178) and human (n=17) including four serotypes (Typhimurium, Rissen, Derby, and Stanley) were randomly selected to examine their genetic relatedness using highly conserved sequence of three genes (fim A, man B, and mdh). Results: The results showed that 195 Salmonella isolates of four different serotypes were grouped into five different clusters, and members of the same Salmonella serotypes were found in the same cluster. Salmonella isolated from pig production and human in Thailand-Laos border provinces represented overlapping population and revealed a high degree of similarity, indicating close genetic relationship among the isolates. Conclusion: The results support that the determination of Salmonella serotyping combined with analysis of phylogenetic tree can be used track the clonal evolution and genetic diversity of Salmonella serotypes in different host species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,544
Score d'incertitude au seuil0,200

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle