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Enregistrement W2910651943 · doi:10.6084/m9.figshare.4330688

Additional file 2: Figure S1. of Disorders of sex development: insights from targeted gene sequencing of a large international patient cohort

2016· article· en· W2910651943 sur OpenAlexaboutno aff
Stefanie Eggers, Simon Sadedin, Jocelyn van den Bergen, Gorjana Robevska, Thomas Ohnesorg, Jacqueline Hewitt, Luke S. Lambeth, Aurore Bouty, Ingrid Knarston, Tiong Yang Tan, Fergus Cameron, George A. Werther, John Hutson, Michele OâConnell, Sonia Grover, Yves Héloury, Margaret Zacharin, Philip Bergman, Chris Kimber, Justin Brown, Nathalie Webb, Matthew F. Hunter, Shubha Srinivasan, Angela Titmuss, Charles F. Verge, David Mowat, Grahame Smith, Janine Smith, Lisa Ewans, Carolyn Shalhoub, Patricia Crock, Chris Cowell, Gary M. Leong, Makato Ono, Antony Lafferty, Tony Huynh, Uma Visser, Catherine S. Choong, Fiona McKenzie, Nicholas Pachter, Elizabeth Thompson, Jennifer Couper, Anne Baxendale, Jozef Gécz, Benjamin J. Wheeler, Craig Jefferies, Karen E. MacKenzie, Paul L. Hofman, Philippa Carter, Richard King, Csilla Krausz, Conny M.A. van Ravenswaaij‐Arts, Leendert H. J. Looijenga, S L S Drop, Stefan Riedl, Martine Cools, Angelika J. Dawson, Achmad Zulfa Juniarto, Vaman Khadilkar, Anuradha Khadilkar, Vijayalakshmi Bhatia, Vĺš DĹŠng, Irum Atta, Jamal Raza, Nguyen Thi Diem, Tran Kiem Hao, Vincent R. Harley, Peter Koopman, Garry L. Warne, Sultana MH Faradz, Alicia Oshlack, Katie Ayers, Andrew Sinclair

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSexual Differentiation and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohortCohort studyGeneMedicineGeneticsBiologyDemographyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DSD gene variants in different global regions. DSD gene variants among the international cohort of 46,XY DSD patients. For ease of analysis, countries were grouped together into regions: Asia comprises Indonesia (97), Pakistan (25), Vietnam (35), Cambodia (16), India (1), a total of 174 patients ; Europe comprises the Netherlands (38), Austria (15), Belgium (6), and Italy (2), a total of 61 patients; and AUS & NZL comprises Australia (83) and New Zealand (7), a total of 90 patients. All curated variants are shown; those which have been curated and called pathogenic, likely pathogenic, and VUS. In the cohort from Asia, 35% of the patients were found to have a diagnostic variant (pathogenic or likely pathogenic), while this was 44% for Europe and 45% for AUS/NZL. Two patients from Canada were not included in the diagram. (PPTX 158 kb)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,164
Score d'incertitude au seuil0,234

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,8360,121

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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