A new case of spastic paraplegia type 64 due to a missense mutation in the ENTPD1 gene
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Spastic paraplegia type 64 (SPG64; OMIM 615683) is a complicated form of hereditary spastic paraplegia (HSP) recently identified in individuals diagnosed with suspected neurodegenerative disease. Affected patients carry homozygous mutations in the ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 gene (ENTPD1). Although they share common characteristics, affected individuals show slight discrepancies in some clinical aspects. At present, only two different cases of SPG64 have been diagnosed. More findings of genetic variation would be helpful to better understand the effect of mutations in the ENTPD1 gene on the neurological condition of affected individuals. In this study, we examined a family with an individual diagnosed with suspected HSP based on clinical findings. DNA samples from the proband, her affected sister, and both parents were analyzed using next-generation sequencing. We used an in-house automated pipeline to detect potential neuromuscular disease-causing variants. Variants were confirmed by Sanger sequencing. After cosegregation analysis, the variant NM_001776.5:c.401T>G (p.M134R) of the ENTPD1 gene was identified as a novel missense mutation linked to the phenotype of SPG64 in the proband and her sister, who showed similar and distinct clinical features compared with the two cases previously described in the literature.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».