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Enregistrement W2911042793 · doi:10.6026/97320630014482

Molecular docking analysis of Cianidanol from Ginkgo biloba with HER2+ breast cancer target

2018· article· en· W2911042793 sur OpenAlexaff
Abiodun Julius Arannilewa, Oluwaseun Suleiman Alakanse, Adesola Oluwaseun Adeleye, Oluwaseyi Israel Malachi, Ifedayo Michael Obaidu, Oluwafemi Emmanuel Ekun, Emmanuel Damilola Afolayan, Patricia Folakemi Afere, Kayode Abdullateef Ayuba, Tolulope O. Bolarinwa, George Oche Ambrose

Notice bibliographique

RevueBioinformation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensEbro Foods (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLapatinibGinkgo bilobaTrastuzumab emtansineTrastuzumabMedicineBreast cancerPharmacologyDocking (animal)CancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HER2 is a known therapeutic target for about 30% of breast cancer patients where HER2 is over expressed and this is referred to as HER2 positive breast cancer. This subtype is characterized by a clinical behavior know to be especially aggressive. Improved HER2 targeting agents such as trastuzumab, pertuzumb, lapatinib and ado-trastuzumab emtansine are available. Some patients have shown no response to treatment while others show progress to these agents. Therefore, it is of interest to screen HER2+ with phyto-chemical lead compound from Ginkgo biloba using molecular docking techniques. We screened 25 phyto-chemicals from literature with HER2+. Results show that cianidanol have an acceptable binding energy of (-8.2kcal/mol). Thus, we report the binding properties of cianidanol with HER2+.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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