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Enregistrement W2911081517 · doi:10.1038/s41431-018-0311-3

Return of individual genomic research results: are laws and policies keeping step?

2019· article· en· W2911081517 sur OpenAlexafffund
Adrian Thorogood, Gratien Dalpé, Bartha Maria Knoppers

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Human Genetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesGenome Canada
Mots-clésBiobankCorporate governanceDivergence (linguistics)LegislatureConfusionPersonal genomicsQuality (philosophy)Public relationsBusinessPolitical scienceLawWhole genome sequencingPsychologyBiologyGeneticsGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Efforts are underway to harmonise the return of individual results and incidental findings from whole genome sequencing (WGS) across research contexts and countries. We reviewed international, regional and national laws and policies applying to return across 20 countries to identify areas of convergence and divergence. Discrepancies between laws and policies are most problematic where they cannot be reconciled through harmonisation of project-level governance. Rules for the return of results apply at different levels in different jurisdictions (e.g., human subjects research, biobanks, clinical trials, genomic sequencing, and genetic/personal data), complicating comparison. A particular concern for harmonisation are the (often contradictory) rules about when results must, should, may, or must not be returned. Adding confusion are different thresholds for utility (medical, familial, reproductive, and/or personal). The importance of respecting individual choices to know or not know is widely recognised, though some norms emphasise respect for personal preferences. Another troubling observation is that requirements for data quality, variant assessment, and the effective communication of results are evolving in uneven ways. There is a growing gap between researchers with the expertise, infrastructure, and resources to meet these requirements and those without, threatening international collaboration. Best practices for the return of individual genomic results are sorely needed to inform not only the ethical return of results, but also future legislative and policy efforts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,367
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,449
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,367
Score d'incertitude au seuil0,781

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3670,449
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0070,042
Communication savante0,0230,038
Science ouverte0,0090,013
Intégrité de la recherche0,0240,035
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations113
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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