The adaptor protein Ste50 directly modulates yeast MAPK signaling specificity through differential connections of its RA domain
Notice bibliographique
Résumé
Discriminating among diverse environmental stimuli is critical for organisms to ensure their proper development, homeostasis, and survival. Saccharomyces cerevisiae regulates mating, osmoregulation, and filamentous growth using three different MAPK signaling pathways that share common components and therefore must ensure specificity. The adaptor protein Ste50 activates Ste11p, the MAP3K of all three modules. Its Ras association (RA) domain acts in both hyperosmolar and filamentous growth pathways, but its connection to the mating pathway is unknown. Genetically probing the domain, we found mutants that specifically disrupted mating or HOG-signaling pathways or both. Structurally these residues clustered on the RA domain, forming distinct surfaces with a propensity for protein-protein interactions. GFP fusions of wild-type (WT) and mutant Ste50p show that WT is localized to the shmoo structure and accumulates at the growing shmoo tip. The specifically pheromone response-defective mutants are severely impaired in shmoo formation and fail to localize ste50p, suggesting a failure of association and function of Ste50 mutants in the pheromone-signaling complex. Our results suggest that yeast cells can use differential protein interactions with the Ste50p RA domain to provide specificity of signaling during MAPK pathway activation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».