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Enregistrement W2911175697 · doi:10.1371/journal.pone.0210732

Adhesion molecule gene variants and plasma protein levels in patients with suspected obstructive sleep apnea

2019· article· en· W2911175697 sur OpenAlexafffund
Andrew J. Sandford, Amanda Ha, David A. Ngan, Loubna Akhabir, Aabida Saferali, Nurit Fox, A. J. Hirsch Allen, Simon C. Warby, Stephan F. van Eeden, Najib Ayas

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueObstructive Sleep Apnea Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital du Sacré-Cœur de MontréalUniversity of British ColumbiaCanadian Sleep & Circadian NetworkUniversity of British Columbia HospitalSt. Paul's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBritish Columbia Lung Association
Mots-clésObstructive sleep apneaInternal medicineEndothelial activationAlleleMedicineCell adhesion moleculeIntercellular Adhesion Molecule-1Polymorphism (computer science)ImmunologyGastroenterologyEndocrinologyBiologyGeneticsGeneEndothelium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

STUDY OBJECTIVES: Untreated obstructive sleep apnea (OSA) patients have an increased risk of cardiovascular disease (CVD). Adhesion molecules, including soluble E-selectin (sE-selectin), intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1), and vascular adhesion molecule-1 (VCAM-1), are associated with incident CVD. We hypothesized that specific genetic variants will be associated with plasma levels of adhesion molecules in suspected OSA patients. We also hypothesized that there may be an interaction between these variants and OSA. METHODS: We measured levels of sE-selectin, sICAM-1 and sVCAM-1 in 491 patients with suspected OSA and genotyped them for 20 polymorphisms. RESULTS: The most significant association was between the ABO rs579459 polymorphism and sE-selectin levels (P = 7×10-21), with the major allele T associated with higher levels. The direction of effect and proportion of the variance in sE-selectin levels accounted for by rs579459 (16%) was consistent with estimates from non-OSA cohorts. In a multivariate regression analysis, addition of rs579459 improved the model performance in predicting sE-selectin levels. Three polymorphisms were nominally associated with sICAM-1 levels but none with sVCAM-1 levels. The combination of severe OSA and two rs579459 T alleles identified a group of patients with high sE-selectin levels; however, the increase in sE-selectin levels associated with severe OSA was greater in patients without two T alleles (P = 0.05 test for interaction). CONCLUSIONS: These genetic polymorphisms may help to identify patients at greatest risk of incident CVD and may help in developing a more precision-based approach to OSA care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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