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Enregistrement W2911425415 · doi:10.1101/528513

Individuals’ expected genetic contributions to future generations, reproductive value, and short-term metrics of fitness in free-living song sparrows ( <i>Melospiza melodia</i> )

2019· preprint· en· W2911425415 sur OpenAlexafffund
Jane M. Reid, Pirmin Nietlisbach, Matthew E. Wolak, Lukas F. Keller, Peter Arcese

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Behavior and Reproduction
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésReproductive valueTerm (time)Reproductive successGenetic FitnessValue (mathematics)Variation (astronomy)BiologyEvolutionary biologyStatisticsDemographyMathematicsPopulationBiological evolutionGeneticsSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Appropriately defining and enumerating ‘fitness’ is fundamental to explaining and predicting evolutionary dynamics. Yet theoretical concepts of fitness are often hard to translate into quantities that can be quantified in wild populations experiencing complex environmental, demographic, genetic and selective variation. While the ‘fittest’ entities might be widely understood to be those that ultimately leave most descendants at some future time, such long-term legacies are hard to measure, impeding evaluation of how well more tractable short-term metrics of individual fitness directly predict longer-term outcomes. One opportunity for conceptual and empirical convergence stems from the principle of individual reproductive value ( V i ), defined as the number of copies of each of an individual’s alleles that is expected to be present in future generations given the individual’s realised pedigree of descendants. Since V i tightly predicts an individual’s longer-term genetic contribution, quantifying V i provides a tractable route to quantifying what, to date, has been an abstract fitness concept. We used complete pedigree data from free-living song sparrows ( Melospiza melodia ) to demonstrate that individuals’ expected genetic contributions stabilise within an observed 20-year time period, allowing individual V i to be evaluated. Considerable among-individual variation in V i was evident in both sexes. However, standard short-term metrics of individual fitness, comprising lifespan, lifetime reproductive success and projected growth rate, typically explained less than half the variation. Given these results, we discuss what evolutionary inferences can and cannot be directly drawn from short-term versus longer-term fitness metrics observed on individuals, and highlight that analyses of pedigree structure may provide useful complementary insights into evolutionary processes and outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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