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Enregistrement W2911608346 · doi:10.1182/blood-2018-99-118063

PARP14 Is a Novel Therapeutic Target in STAT6 mutant Follicular Lymphoma

2018· article· en· W2911608346 sur OpenAlexaff
Verena Passerini, Michael Boesl, Elisabeth Silkenstedt, Elisa Osterode, Michael Heide, Robert Kridel, Christoph Ziegenhain, Annette M. Staiger, German Ott, Monika Szczepanowski, Julia Richter, Wolfgang Hiddemann, Andreas Rosenwald, Wolfgang Enard, Deepak Bararia, Ursula Zimber‐Strobl, Oliver Weigert

Notice bibliographique

RevueBlood · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSTAT6BiologyMutantFollicular lymphomaGeneMolecular biologyCancer researchLymphomaCell biologyGeneticsTranscription factorImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The highly variable clinical course of follicular lymphoma (FL) is determined by the molecular heterogeneity of the tumor cells and complex interactions with the microenvironment. The underlying molecular mechanisms and therapeutic vulnerabilities are not well understood. IL-4 producing follicular helper T cells (TFH) have been identified as a key component of the malignant B-cell niche. IL-4 activates paracrine signaling via STAT6. In a cohort of 258 patients with advanced stage FL, we identified STAT6 mutations in 13% of diagnostic biopsies (n=33). All mutations were clustered within the DNA binding domain, mostly at D419, and included a polymorphic variant (rs11172102). Gene set enrichment analysis (GSEA) revealed that STAT6 mutant cases were significantly enriched for two distinct IL-4 gene expression signatures. Gene expression data and immunohistochemistry of primary FL samples showed significant up-regulation of IL-4/STAT6 target genes in STAT6 mutant cases, including FCER2, which encodes for CD23. We stably expressed wild type STAT6 or mutant STAT6 (D419G, N421K, and D519V) in two B-cell lymphoma lines (OCI-Ly1, OCI-Ly8), both harboring the FL hallmark translocation t(14;18). Upon IL-4 stimulation, cells expressing mutant STAT6 had significantly increased FCER2 transcript levels. Similarly, IL-4 induced expression of membrane-bound as well as soluble CD23 was significantly increased in STAT6 mutant cells. Cells expressing mutant STAT6 showed significantly increased nuclear accumulation of pSTAT6 following IL-4 stimulation. Of note, we did not observe any effect of STAT6 mutations in the absence of IL-4. RNA sequencing of IL-4-stimulated lymphoma cell lines (STAT6 mutant versus wild type) identified PARP14 -a known transcriptional co-activator of STAT6- among the top differentially expressed genes. Bioinformatics and functional experiments demonstrated that PARP14 per se is a novel STAT6 target gene. Furthermore, reporter assays showed increased transactivation activity of mutant STAT6 at the PARP14 promotor, suggesting a regulatory feed-forward loop. Pharmacological inhibition of PARP and knock-down of PARP14 completely abrogated the mutant STAT6 gain-of-function phenotype. In summary, our results suggest that PARP14 is a novel target in STAT6 mutant FL. Our data also imply that the biological and clinical impact of STAT6 mutations will heavily depend on the (targetable) upstream activation of the IL-4 signaling cascade, including the abundance of IL-4 / TFH cells in the microenvironment of FL. Disclosures Richter: HTG Molecular Diagnostics, Inc.: Research Funding. Klapper:Amgen: Honoraria, Research Funding; F.Hoffman-La Roche: Honoraria, Research Funding; HTG Molecular Diagnostics, Inc.: Research Funding; Takeda: Honoraria, Research Funding; Regeneron: Honoraria, Research Funding. Hiddemann:Janssen: Consultancy, Honoraria, Membership on an entity's Board of Directors or advisory committees, Research Funding; Celgene: Consultancy, Honoraria, Membership on an entity's Board of Directors or advisory committees, Research Funding; F. Hoffman-La Roche: Consultancy, Honoraria, Membership on an entity's Board of Directors or advisory committees, Research Funding; Bayer: Consultancy, Research Funding. Weigert:Novartis: Research Funding; Roche: Research Funding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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