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Enregistrement W2911756006 · doi:10.14745/ccdr.v45i23a01

Multidrug-resistant and extensively drug-resistant Neisseria gonorrhoeae in Canada, 2012–2016

2019· article· en· W2911756006 sur OpenAlexafffundvenueabout
Irene Martín, Pam Sawatzky, Vanessa Allen, Brigitte Lefebvre, Prenilla Naidu, Jessica Minion, Paul Van Caeseele, David Haldane, RR Gad, George Zahariadis, André Corriveau, Greg J. German, K Tomas, M. R. Mulvey

Notice bibliographique

RevueCanada Communicable Disease Report · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensHealth PEIQueen Elizabeth II Health Sciences CentreSaskatchewan Disease Control LaboratoryGovernment of Northwest TerritoriesProvincial Laboratory of Public HealthGovernment of New BrunswickBC Centre for Disease ControlPublic Health OntarioToronto Public HealthPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésNeisseria gonorrhoeaeAzithromycinCephalosporinAntimicrobialMedicineAgar dilutionAntibiotic resistanceGonorrheaMultiple drug resistanceDrug resistanceMicrobiologyAntibioticsInternal medicineVirologyBiologyMinimum inhibitory concentrationHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Neisseria gonorrhoeae have acquired resistance to many antimicrobials, including third generation cephalosporins and azithromycin, which are the current gonococcal combination therapy recommended by the Canadian Guidelines on Sexually Transmitted Infections.Objective: To describe antimicrobial susceptibilities for N. gonorrhoeae circulating in Canada between 2012 and 2016.Methods: Antimicrobial resistance profiles were determined using agar dilution of N. gonorrhoeae isolated in Canada 2012-2016 (n=10,167) following Clinical Laboratory Standards Institute guidelines.Data were analyzed by applying multidrug-resistant gonococci (MDR-GC) and extensively drug-resistant gonococci (XDR-GC) definitions.Results: Between 2012 and 2016, the proportion of MDR-GC increased from 6.2% to 8.9% and a total of 19 cases of XDR-GC were identified in Canada (0.1%, 19/18,768).The proportion of isolates with decreased susceptibility to cephalosporins declined between 2012 and 2016 from 5.9% to 2.0% while azithromycin resistance increased from 0.8% to 7.2% in the same period.Conclusion: While XDR-GC are currently rare in Canada, MDR-GC have increased over the last five years.Azithromycin resistance in N. gonorrhoeae is established and spreading in Canada, exceeding the 5% level at which the World Health Organization states an antimicrobial should be reviewed as an appropriate treatment.Continued surveillance of antimicrobial susceptibilities of N. gonorrhoeae is necessary to inform treatment guidelines and mitigate the impact of resistant gonorrhea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,250

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2019
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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