Implementing DPYD*2A genotyping in clinical practice, the Quebec experience.
Notice bibliographique
Résumé
650 Background: Fluoropyrimidines (FU) are part of chemotherapy combinations for multiple gastrointestinal cancers. Deficient dihydropyrimidine deshydrogenase (DPD) activity can lead to severe life-threatening toxicities in 3-5% of populations tested. The DPYD*2A polymorphism leading to deficient DPD activity is one of the most studied variants. Methods: We retrospectively performed chart reviews of all patients that tested positive for a heterozygous or homozygous DPYD*2A mutation in samples obtained from patients throughout the province of Quebec (Canada). The study objective was to document the impact of implementing this test in routine clinical practice, including the effects on treatment types, delays and toxicities. Results: 2,617 patients were tested by PCR for the presence of DPYD*2A in a period of 17 months: 25 patients tested positive. All were Caucasian. 24 of the 25 patients were heterozygous (0.92%) and one was homozygous (0.038%). A chart review was available for 20 patients: 15 were tested upfront while five were performed following severe toxicities on the first cycle of FU-based chemotherapy. Of the five patients identified following toxicities, all had grade 4 cytopenias, 80% grade ≥ 3 mucositis, 20% grade 3 rash and 20% grade 3 diarrhea, with an average of 15 days of hospitalisations due to febrile neutropenia. Seven of the 13 patients identified upfront received FU-based chemotherapy at reduced initial doses ranging from 25 to 50%. The average dose during the course of chemotherapy was 50% and two patients reached 100% dosage. No grade ≥ 3 toxicities were observed. DPYD*2A test results were available in an average of 6 days, causing no significant delays in treatment initiation according to 99% of queried physicians. Conclusions: Upfront genotyping before FU-based treatment is feasible in clinical practice. It may prevent severe toxicities and hospitalisations without delaying treatment initiation. The administration of chemotherapy at reduced doses appears to be safe in patients heterozygous for DPYD*2A.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».