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Enregistrement W2912147306 · doi:10.1101/527481

Conduit integrity is compromised during acute lymph node expansion

2019· preprint· en· W2912147306 sur OpenAlexaff
Víctor G. Martínez, Valeriya Pankova, Lukáš Krásný, Tanya Singh, Ian J. White, Agnesska C. Benjamin, Simone Dertschnig, Harry L. Horsnell, János Kriston-Vizi, Jemima J. Burden, Paul H. Huang, Christopher J. Tape, Sophie E. Acton

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Science FoundationCancer Research UKWellcome TrustEuropean Hematology AssociationSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
Mots-clésExtracellular matrixCell biologyImmune systemChemistryAntigenLymph nodeMatrix (chemical analysis)ImmunologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lymph nodes (LNs) work as filtering organs, constantly sampling peripheral cues. This is facilitated by the conduit network, a parenchymal tubular-like structure formed of bundles of aligned extracellular matrix (ECM) fibrils ensheathed by fibroblastic reticular cells (FRCs). LNs undergo 5-fold expansion with every adaptive immune response and yet these ECM-rich structures are not permanently damaged. Whether conduit integrity and filtering functions are affected during cycles of LN expansion and resolution is not known. Here we show that the conduit structure is disrupted during acute LN expansion but FRC-FRC contacts remain intact. In homeostasis, polarised FRCs adhere to the underlying substrate to deposit ECM ba-solaterally. ECM production by FRCs is regulated by the C-type lectin CLEC-2, expressed by dendritic cells (DCs), at transcriptional and secretory levels. Inflamed LNs maintain conduit size-exclusion, but flow becomes leaky, which allows soluble antigens to reach more antigen-presenting cells. We show how dynamic communication between peripheral tissues and LNs changes during immune responses, and describe a mechanism that enables LNs to prevent inflammation-induced fibrosis. Highlights FRCs use polarized microtubule networks to guide matrix deposition CLEC-2/PDPN controls matrix production at transcriptional and post-transcriptional levels FRCs halt matrix production and decouple from conduits during acute LN expansion Conduits leak soluble antigen during acute LN expansion

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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