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Enregistrement W2912167963 · doi:10.1158/0008-5472.can-18-1261

<i>Sleeping Beauty</i> Insertional Mutagenesis Reveals Important Genetic Drivers of Central Nervous System Embryonal Tumors

2019· article· en· W2912167963 sur OpenAlexaff
Pauline J. Beckmann, Jon D. Larson, Alex T. Larsson, Jason Ostergaard, Eric P. Rahrmann, Ghaidan A. Shamsan, George M. Otto, Rory L. Williams, Jun Wang, Catherine Lee, Barbara R. Tschida, Paramita Das, Adrian M. Dubuc, Branden S. Moriarity, Daniel Picard, Xiaochong Wu, Fausto J. Rodríguez, Quincy Rosemarie, Ryan D. Krebs, Amy M. Molan, Addison M. Demer, Michelle M. Frees, Anthony E. Rizzardi, Stephen C. Schmechel, Charles G. Eberhart, Robert B. Jenkins, Robert J. Wechsler‐Reya, David J. Odde, Annie Huang, Michael D. Taylor, Aaron L. Sarver, David A. Largaespada

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthAmerican Cancer Society
Mots-clésInsertional mutagenesisBiologyMutagenesisGeneticsCentral nervous systemNeuroscienceMutationGeneGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Medulloblastoma and central nervous system primitive neuroectodermal tumors (CNS-PNET) are aggressive, poorly differentiated brain tumors with limited effective therapies. Using Sleeping Beauty (SB) transposon mutagenesis, we identified novel genetic drivers of medulloblastoma and CNS-PNET. Cross-species gene expression analyses classified SB-driven tumors into distinct medulloblastoma and CNS-PNET subgroups, indicating they resemble human Sonic hedgehog and group 3 and 4 medulloblastoma and CNS neuroblastoma with FOXR2 activation. This represents the first genetically induced mouse model of CNS-PNET and a rare model of group 3 and 4 medulloblastoma. We identified several putative proto-oncogenes including Arhgap36, Megf10, and Foxr2. Genetic manipulation of these genes demonstrated a robust impact on tumorigenesis in vitro and in vivo. We also determined that FOXR2 interacts with N-MYC, increases C-MYC protein stability, and activates FAK/SRC signaling. Altogether, our study identified several promising therapeutic targets in medulloblastoma and CNS-PNET. Significance: A transposon-induced mouse model identifies several novel genetic drivers and potential therapeutic targets in medulloblastoma and CNS-PNET.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,557

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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