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Enregistrement W2912244431 · doi:10.5376/mpb.2019.10.0002

Precisely Positioning QTLs for Premature Senescence Resistance in Asparagus Bean Using a High-density SNP Chip

2019· article· en· W2912244431 sur OpenAlexvenueno aff
Lijuan Huang, Xilin Yuan, Xinyi Wu, Ying Wang, Xiaohua Wu, Baogen Wang, Zhongfu Lu, Guojing Li, Pei Xu

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAgricultural pest management studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAsparagusSNPSNP genotypingSenescenceResistance (ecology)GeneticsBiotechnologyBotanyGeneGenotypeSingle-nucleotide polymorphismAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Premature senescence (PS) is an important adverse agronomic trait of asparagus bean. Since immature pods are the major economic organ for asparagus bean, PS will influence the pod number in late stage which leads to the decline of pod yield and brings economic losses to growers. Using an enlarged recombinant inbred line population (RIL, F6:8) comprising 119 lines from the cross of ZN016 and ZJ282 as materials, the study carried out the quantitative trait loci (QTL) precise positioning of PS resistance traits of asparagus bean based on the high density molecular genetic map with 8,032 SNP loci which was constructed by the 60K high-density SNP chip of cowpea. We positioned the major QTLs for PS resistance of asparagus bean to an about 0.424 cM interval on LG11. Compared with previous results of QTL positioning of the same trait, the coarse positioning results in the early stage of this laboratory were confirmed, and the accuracy of QTL positioning was greatly improved which greatly reduced the distance between the wing markers. This study might provide the basis for molecular marker-assisted breeding and gene cloning against the agronomic trait of PS resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,926
Score d'incertitude au seuil0,397

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
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