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Enregistrement W2912289782 · doi:10.1101/541060

Common functional networks in the mouse brain revealed by multi-centre resting-state fMRI analysis

2019· preprint· en· W2912289782 sur OpenAlexaff
Joanes Grandjean, Carola Canella, Cynthia Anckaerts, Gülebru Ayrancı, Salma Bougacha, Thomas Bienert, David Buehlmann, Ludovico Coletta, Daniel Gallino, Natalia Gass, Clément M. Garin, Nachiket A. Nadkarni, Neele S. Hübner, Meltem Karatas, Yuji Komaki, Silke Kreitz, Francesca Mandino, Anna E. Mechling, Chika Sato, Katja Sauer, Disha Shah, Sandra Strobelt, Norio Takata, Isabel Wank, Tong Wu, Noriaki Yahata, Ling Yun Yeow, Yohan Yee, Ichio Aoki, M. Mallar Chakravarty, Wei‐Tang Chang, Marc Dhénain, Dominik von Elverfeldt, Laura-Adela Harsan, Andreas Heß, Tianzi Jiang, Georgios A. Keliris, Jason P. Lerch, Hideyuki Okano, Markus Rudin, Alexander Sartorius, Annemie Van der Linden, Marleen Verhoye, Wolfgang Weber‐Fahr, Nicole Wenderoth, Valerio Zerbi, Alessandro Gozzi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoQueen's UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesJapan Agency for Medical Research and DevelopmentFonds Wetenschappelijk OnderzoekDeutsche ForschungsgemeinschaftBpifranceBundesministerium für Bildung und ForschungBrainLinks-BrainToolsNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologySimons Foundation Autism Research InitiativeVlaamse regeringSimons Foundation
Mots-clésResting state fMRIDefault mode networkFunctional magnetic resonance imagingFunctional connectivityComputer scienceNeuroimagingNeurosciencePipeline (software)Set (abstract data type)Pattern recognition (psychology)Artificial intelligencePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Preclinical applications of resting-state functional magnetic resonance imaging (rsfMRI) offer the possibility to non-invasively probe whole-brain network dynamics and to investigate the determinants of altered network signatures observed in human studies. Mouse rsfMRI has been increasingly adopted by numerous laboratories world-wide. Here we describe a multi-centre comparison of 17 mouse rsfMRI datasets via a common image processing and analysis pipeline. Despite prominent cross-laboratory differences in equipment and imaging procedures, we report the reproducible identification of several large-scale resting-state networks (RSN), including a murine default-mode network, in the majority of datasets. A combination of factors was associated with enhanced reproducibility in functional connectivity parameter estimation, including animal handling procedures and equipment performance. Our work describes a set of representative RSNs in the mouse brain and highlights key experimental parameters that can critically guide the design and analysis of future rodent rsfMRI investigations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,403
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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