Formalin Tissue Fixation Biases Myelin-Sensitive MRI
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose Chemical fixatives, such as formalin, form cross-links between proteins and affect the relaxation times and diffusion properties of tissue. These fixation-induced changes likely also affect myelin density measurements produced by quantitative magnetization transfer (qMT) and myelin water imaging (MWI). In this work, we evaluate these myelin-sensitive MRI methods for fixation-induced biases. Methods We perform qMT, MWI, and D 2 O-exchanged zero echo-time (ZTE) imaging on unfixed human spinal cord tissue, and repeat these measurements after 1 day and 31 days of formalin fixation. Results The qMT bound pool fraction increased by 30.7±21.1% after 1 day of fixation and by 42.6±33.9% after 31 days of fixation. Myelin water fraction increased by 39.7±15.5% and 37.0±15.9% at these same time points, and mean T 2 of the myelin water pool nearly doubled. Reference-normalized D 2 O-exchanged ZTE signal intensity increased by 8.17±6.03% after 31 days of fixation, but did not change significantly after 1 day of fixation. After fixation, specimen cross-sectional area decreased by approximately 5%; after correction for shrinkage, changes in D 2 O-exchanged ZTE intensity were nearly eliminated. Conclusion F and MWF are significantly increased by formalin fixation, while D 2 O-exchanged ZTE intensity is minimally affected. Changes in qMT and MWI may be due, in part, to delamination and formation of vacuoles in the myelin sheath. D 2 O-exchanged signal intensity may be altered by fixation-induced changes in myelin lipid solid-state 1 H T 1 . We urge caution in the comparison of these measurements across subjects or specimens in different states, especially unfixed vs. fixed tissue.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».