Circadian genes and risk of prostate cancer: Findings from the EPICAP study
Notice bibliographique
Résumé
Circadian rhythms regulate several physiological functions and genes controlling the circadian rhythm were found to regulate cell proliferation, cell cycle and apoptosis. Few studies have investigated the role of those circadian genes in prostate cancer occurrence. We aim to investigate the relationship between circadian genes polymorphisms and prostate cancer risk based on data from the EPICAP study, a population-based case-control study including 1,515 men (732 cases / 783 controls) with genotyped data. Odds Ratios (ORs) for association between prostate cancer and circadian gene variants were estimated for each of the 872 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 31 circadian clock genes. We also used a gene-based and pathway-based approach with a focus on the pathway including 9 core circadian genes. Separate analyses were conducted by prostate cancer aggressiveness. The core-circadian pathway (p = 0.0006) was significantly associated to prostate cancer, for either low (p = 0.002) or high (p = 0.01) grade tumor. At the gene level, we observed significant associations between all prostate cancer and NPAS2 and PER1 after correcting for multiple testing, while only RORA was significant for aggressive tumors. At the SNP-level, no significant association was observed. Our findings provide additional evidence of a potential link between genetic variants in circadian genes and prostate cancer risk. Further investigation is warranted to confirm these findings and to better understand the biological pathways involved.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».