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Enregistrement W2912876039 · doi:10.1093/brain/awy346

PLPHP deficiency: clinical, genetic, biochemical, and mechanistic insights

2018· article· en· W2912876039 sur OpenAlexafffund
Devon L. Johnstone, Hilal H. Al-Shekaili, Maja Tarailo‐Graovac, Nicole I. Wolf, Autumn S. Ivy, Scott Demarest, Yann Roussel, Jolita Čiapaitė, Carlo W.T. van Roermund, Kristin D. Kernohan, Ceres Kosuta, Kevin Ban, Yoko Itō, Skye McBride, Khalid Al‐Thihli, Rana Abdelrahim, Roshan Koul, Amna Al‐Futaisi, Charlotte A. Haaxma, Heather E. Olson, Laufey Yr Sigurdardottir, Georgianne L. Arnold, Erica H. Gerkes, M. E. Boon, M. Rebecca Heiner‐Fokkema, Sandra Noble, Marjolein Bosma, Judith Jans, David A. Koolen, Erik-Jan Kamsteeg, Britt I. Drögemöller, Colin J.D. Ross, Jacek Majewski, Megan T. Cho, Amber Begtrup, Wyeth W. Wasserman, Tuan V. Bui, Elise Brimble, Sara Violante, Sander M. Houten, Ron A. Wevers, Martijn van Faassen, Ido P. Kema, Nathalie Lepage, Matthew A. Lines, David A. Dyment, Ronald J. A. Wanders, Nanda M. Verhoeven‐Duif, Marc Ekker, Kym M. Boycott, Jan M. Friedman, Izabella A. Pena, Clara D.M. van Karnebeek

Notice bibliographique

RevueBrain · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalMcGill UniversityChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of CalgaryBC Children's HospitalMcGill University and Génome Québec Innovation CentreUniversity of British ColumbiaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesMinistry of Higher EducationMichael Smith Health Research BCStichting MetakidsCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of Neurological Disorders and StrokeChildren's Hospital of Eastern Ontario FoundationGenome CanadaNational Ataxia FoundationOntario GenomicsGenome British ColumbiaRare Disease FoundationChildren's Hospital Foundation
Mots-clésBiologyPhenotypeEpilepsyDiseaseZebrafishEncephalopathyStatus epilepticusGeneticsBioinformaticsInternal medicineMedicineNeuroscienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biallelic pathogenic variants in PLPBP (formerly called PROSC) have recently been shown to cause a novel form of vitamin B6-dependent epilepsy, the pathophysiological basis of which is poorly understood. When left untreated, the disease can progress to status epilepticus and death in infancy. Here we present 12 previously undescribed patients and six novel pathogenic variants in PLPBP. Suspected clinical diagnoses prior to identification of PLPBP variants included mitochondrial encephalopathy (two patients), folinic acid-responsive epilepsy (one patient) and a movement disorder compatible with AADC deficiency (one patient). The encoded protein, PLPHP is believed to be crucial for B6 homeostasis. We modelled the pathogenicity of the variants and developed a clinical severity scoring system. The most severe phenotypes were associated with variants leading to loss of function of PLPBP or significantly affecting protein stability/PLP-binding. To explore the pathophysiology of this disease further, we developed the first zebrafish model of PLPHP deficiency using CRISPR/Cas9. Our model recapitulates the disease, with plpbp-/- larvae showing behavioural, biochemical, and electrophysiological signs of seizure activity by 10 days post-fertilization and early death by 16 days post-fertilization. Treatment with pyridoxine significantly improved the epileptic phenotype and extended lifespan in plpbp-/- animals. Larvae had disruptions in amino acid metabolism as well as GABA and catecholamine biosynthesis, indicating impairment of PLP-dependent enzymatic activities. Using mass spectrometry, we observed significant B6 vitamer level changes in plpbp-/- zebrafish, patient fibroblasts and PLPHP-deficient HEK293 cells. Additional studies in human cells and yeast provide the first empirical evidence that PLPHP is localized in mitochondria and may play a role in mitochondrial metabolism. These models provide new insights into disease mechanisms and can serve as a platform for drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,697
Score d'incertitude au seuil0,537

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations90
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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