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Enregistrement W2912937798 · doi:10.20411/pai.v4i1.270

The Microbiome of Temporal Arteries

2019· article· en· W2912937798 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePathogens and Immunity · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVasculitis and related conditions
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesArthritis SocietyUnion Chimique BelgeCanadian Rheumatology AssociationCleveland ClinicNational Institutes of HealthAmbrose Monell Foundation
Mots-clésMicrobiomeTemporal arteryBiologyMedicinePathologyBioinformaticsDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: A role for microorganisms in giant cell arteritis (GCA) has long been suspected. We describe the microbiomes of temporal arteries from patients with GCA and controls.Methods: Temporal artery biopsies from patients suspected to have GCA were collected under aseptic conditions and snap-frozen. Fluorescence in situ hybridization (FISH) and long-read 16S rRNA-gene sequencing was used to examine microbiomes of temporal arteries. Taxonomic classification of bacterial sequences was performed to the genus level and relative abundances were calculated. Microbiome differential abundances were analyzed by principal coordinate analysis (PCoA) with comparative Unifrac distances and predicted functional profiling using PICRUSt.Results : Forty-seven patients, including 9 with biopsy-positive GCA, 15 with biopsy-negative GCA and 23 controls without GCA, were enrolled. FISH for bacterial DNA revealed signal in the arterial media. Beta, but not alpha, diversity differed between GCA and control temporal arteries (P = 0.042). Importantly, there were no significant differences between biopsy-positive and biopsy-negative GCA (P > 0.99). The largest differential abundances seen between GCA and non-GCA temporal arteries included Proteobacteria (P), Bifidobacterium (g), Parasutterella (g) and Granulicatella (g) [Log 2-fold change > 4].Conclusion: Temporal arteries are not sterile, but rather are inhabited by a community of bacteria. We have demonstrated that there are microbiomic differences between GCA and non-GCA temporal arteries, but not between biopsy-positive and biopsy-negative GCA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,908
Score d'incertitude au seuil0,102

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle