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Enregistrement W2912947431 · doi:10.1016/j.cell.2018.12.039

Chronic Inflammation Permanently Reshapes Tissue-Resident Immunity in Celiac Disease

2019· article· en· W2912947431 sur OpenAlexaff
Toufic Mayassi, Kristin Ladell, Herman Gudjonson, James E. McLaren, Dustin G. Shaw, Mai T. Tran, Jagoda J. Rokicka, Ian Lawrence, Jean‐Christophe Grenier, Vincent van Unen, Cezary Ciszewski, Matthew Dimaano, Hoda E. Sayegh, Vinod Kumar, Cisca Wijmenga, Peter H.R. Green, Ranjana Gokhale, Hilary Jericho, Carol E. Semrad, Stefano Guandalini, Aaron R. Dinner, Sonia S. Kupfer, Hugh H. Reid, Luis B. Barreiro, Jamie Rossjohn, David A. Price, Bana Jabrì

Notice bibliographique

RevueCell · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCeliac Disease Research and Management
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesWellcome Trust
Mots-clésBiologyInflammationImmunityDiseaseImmunologyImmune systemPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tissue-resident lymphocytes play a key role in immune surveillance, but it remains unclear how these inherently stable cell populations respond to chronic inflammation. In the setting of celiac disease (CeD), where exposure to dietary antigen can be controlled, gluten-induced inflammation triggered a profound depletion of naturally occurring Vγ4 + /Vδ1 + intraepithelial lymphocytes (IELs) with innate cytolytic properties and specificity for the butyrophilin-like (BTNL) molecules BTNL3/BTNL8. Creation of a new niche with reduced expression of BTNL8 and loss of Vγ4 + /Vδ1 + IELs was accompanied by the expansion of gluten-sensitive, interferon-γ-producing Vδ1 + IELs bearing T cell receptors (TCRs) with a shared non-germline-encoded motif that failed to recognize BTNL3/BTNL8. Exclusion of dietary gluten restored BTNL8 expression but was insufficient to reconstitute the physiological Vγ4 + /Vδ1 + subset among TCRγδ + IELs. Collectively, these data show that chronic inflammation permanently reconfigures the tissue-resident TCRγδ + IEL compartment in CeD. Video Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations192
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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