MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2913041225 · doi:10.1002/ijc.32127

Germline <i>BRCA2</i> K3326X and <i>CHEK2</i> I157T mutations increase risk for sporadic pancreatic ductal adenocarcinoma

2019· article· en· W2913041225 sur OpenAlexaff
Ofure Obazee, Lívia Archibugi, Angelo Andriulli, Pavel Souček, Ewa Małecka‐Panas, Audrius Ivanauskas, Theron Johnson, Maria Gazouli, Thomas Pausch, Rita T. Lawlor, Giulia Martina Cavestro, Anna Caterina Milanetto, Milena Di Leo, Claudio Pasquali, Péter Hegyi, Andrea Szentesi, Calin Radu, Cristian Gheorghe, George Theodoropoulos, Frank Bergmann, Hermann Brenner, Ľudmila Vodičková, Verena Katzke, Daniele Campa, Oliver Strobel, Jörg Kaiser, Raffaele Pezzilli, Francesca Federici, Beatrice Mohelníková-Duchoňová, Ugo Boggi, Radmila Lemstrová, Jakob Sidenius Johansen, Stig E. Bojesen, Inna M. Chen, Benny Vittrup Jensen, Gabriele Capurso, Valerio Pazienza, Christos Dervenis, Cosimo Sperti, Andrea Mambrini, Thilo Hackert, Rudolf Kaaks, Daniela Basso, Renata Talar‐Wojnarowska, Evaristo Maiello, Jakob R. Izbicki, Katarina Ćuk, K.-U. Saum, Maurizio Cantore, Juozas Kupčinskas, Orazio Palmieri, Gianfranco Delle Fave, Stefano Landi, Roberto Salvia, Paola Fogar, Yogesh K. Vashist, Aldo Scarpa, Pavel Vodička, Christin Tjaden, Elżbieta Iskierka‐Jazdzewska, Federico Canzian

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensPancreas Centre (Canada)
Organismes subventionnairesSeventh Framework ProgrammeMagyar Tudományos AkadémiaMinisterstvo Zdravotnictví Ceské RepublikyNational Research, Development and Innovation OfficeFondazione Italiana per la ricerca sulle Malattie del PancreasAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroNemzeti Kutatási Fejlesztési és Innovációs HivatalMinistry of HealthMinistero della SaluteGrantová Agentura České RepublikyEuropean CommissionDeutsches Krebsforschungszentrum
Mots-clésCHEK2OncologyOdds ratioGenetic testingInternal medicineGermline mutationFamily historyMedicinePancreatic cancerGermlineAlleleGeneticsBiologyCancerMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rare truncating BRCA2 K3326X (rs11571833) and pathogenic CHEK2 I157T (rs17879961) variants have previously been implicated in familial pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), but not in sporadic cases. The effect of both mutations in important DNA repair genes on sporadic PDAC risk may shed light on the genetic architecture of this disease. Both mutations were genotyped in germline DNA from 2,935 sporadic PDAC cases and 5,626 control subjects within the PANcreatic Disease ReseArch (PANDoRA) consortium. Risk estimates were evaluated using multivariate unconditional logistic regression with adjustment for possible confounders such as sex, age and country of origin. Statistical analyses were two‐sided with p values <0.05 considered significant. K3326X and I157T were associated with increased risk of developing sporadic PDAC (odds ratio (ORdom) = 1.78, 95% confidence interval (CI) = 1.26–2.52, p = 1.19 × 10−3 and ORdom = 1.74, 95% CI = 1.15–2.63, p = 8.57 × 10−3, respectively). Neither mutation was significantly associated with risk of developing early‐onset PDAC. This retrospective study demonstrates novel risk estimates of K3326X and I157T in sporadic PDAC which suggest that upon validation and in combination with other established genetic and non‐genetic risk factors, these mutations may be used to improve pancreatic cancer risk assessment in European populations. Identification of carriers of these risk alleles as high‐risk groups may also facilitate screening or prevention strategies for such individuals, regardless of family history.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,338 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of CancerMême sujetPancreatic and Hepatic Oncology ResearchTravaux en français237 207