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Enregistrement W2913120520

The Dynamic Role of Jumonji C Domain Containing Protein 6 in Placental Development and Disease

2017· dissertation· W2913120520 sur OpenAlexfundno aff
Sruthi Alahari

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2017
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDiseaseDomain (mathematical analysis)Computational biologyMedicineChemistryComputer scienceBiologyInternal medicineMathematics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Perturbations in oxygen sensing are a defining feature of placental-associated pathologies such as preeclampsia, a serious disorder of pregnancy. Preeclamptic placentae have markedly elevated levels of Hypoxia Inducible Factor 1Îą (HIF1A), a master regulator of oxygen homeostasis. Mounting evidence implicates a family of Fe2+ and oxygen-dependent Jumonji C domain containing enzymes (JMJDs) as mediators of the epigenetic code and hypoxic gene expression. While several JMJDs are induced in hypoxia, their role in pregnancy remains unclear. The goal of this study was to characterize JMJD6 function in the placenta in physiological and pathological conditions, and unravel its regulatory relationship with von Hippel Lindau tumour suppressor (VHL), a key executor of the cellular hypoxic response. JMJD6 expression inversely correlated with changes in oxygen tension during placental development, while JMJD6 protein and mRNA were significantly elevated in low oxygen and in early-onset preeclamptic (E-PE) placentae. In vitro demethylation assays revealed that optimal JMJD6-dependent demethylation of its histone targets, H3R2me2s and H4R3me2s, occurred in normoxia, and this was impaired in E-PE placentae due to a hypoxia-iron imbalance. In cytotrophoblast cells, JMJD6 is a positive regulator of VHL gene expression in normoxia. Accordingly, JMJD6 histone targets in E-PE placentae showed marked reductions in their association with VHL promoter regions. Independent of VHL gene regulation, JMJD6 also controlled VHL protein stability through lysyl hydroxylation and promoting its SUMO1-dependent SUMOylation. Importantly, the Jumonji C catalytic domain was found to be indispensable in executing both functions of JMJD6. In summary, these data signify a novel function for JMJD6 as an oxygen sensor in the human placenta, exerting a dual role in regulating VHL gene and protein. Uncovering epigenetic oxygen sensing mechanisms controlling HIF1A is crucial for defining the unique molecular signature of preeclampsia, which may ultimately translate to molecular-based diagnosis and therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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