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Enregistrement W2913194142 · doi:10.1111/petr.13364

Non‐invasive differentiation of non‐rejection kidney injury from acute rejection in pediatric renal transplant recipients

2019· article· en· W2913194142 sur OpenAlexafffund
Ben Archdekin, Atul Sharma, Ian W. Gibson, David N. Rush, David S. Wishart, Tom Blydt‐Hansen

Notice bibliographique

RevuePediatric Transplantation · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British ColumbiaUniversity of AlbertaThe Metabolomics Innovation CentreUniversity of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of ManitobaQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchBC Children's Hospital
Mots-clésMedicineKidney transplantationInternal medicineUrineKidneyTransplantationMetaboliteGastroenterologyUrology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acute kidney injury (AKI) is a major concern in pediatric kidney transplant recipients, where non-alloimmune causes must be distinguished from rejection. We sought to identify a urinary metabolite signature associated with non-rejection kidney injury (NRKI) in pediatric kidney transplant recipients. Urine samples (n = 396) from 60 pediatric transplant participants were obtained at time of kidney biopsy and quantitatively assayed for 133 metabolites by mass spectrometry. Metabolite profiles were analyzed via projection on latent structures discriminant analysis. Mixed-effects regression identified laboratory and clinical predictors of NRKI and distinguished NRKI from T cell-mediated rejection (CMR), antibody-mediated rejection (AMR), and mixed CMR/AMR. Urine samples (n = 199) without rejection were split into NRKI (n = 26; ΔSCr ≥25%), pre-NRKI (n = 35; ΔSCr ≥10% and <25%), and no NRKI (n = 138; ΔSCr <10%) groups. The NRKI discriminant score (dscore) distinguished between NRKI and no NRKI (AUC = 0.86; 95% CI = 0.79-0.94), confirmed by leave-one-out cross-validation (AUC = 0.79; 95% CI = 0.68-0.89). The NRKI dscore also distinguished between NRKI and pre-NRKI (AUC = 0.82; 95% CI = 0.71-0.93). In a linear mixed-effects regression model to account for repeated measures, the NRKI dscore was independent of concurrent rejection, but there was a non-statistical trend for higher dscores with rejection severity. A second exploratory classifier developed to distinguish NRKI from clinical rejection had similar test characteristics (AUC = 0.81, 95% CI = 0.70-0.92, confirmed by LOOCV). This study demonstrates the potential of a urine metabolite classifier to detect NRKI in pediatric kidney transplant patients and non-invasively discriminate NRKI from rejection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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