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Enregistrement W2913197465 · doi:10.1101/531491

Requirement for TRanslocon-Associated Protein (TRAP) α in insulin biogenesis

2019· preprint· en· W2913197465 sur OpenAlexaff
Xin Li, Omar A. Itani, Leena Haataja, Kathleen J. Dumas, Jing Yang, Jeeyeon Cha, Stéphane Flibotte, Hung‐Jen Shih, Jialu Xu, Ling Qi, Peter Arvan, Ming Liu, Patrick J Hu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreMichael Smith Health Research BCUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Natural Science Foundation of ChinaAmerican Heart Association
Mots-clésProinsulinEndoplasmic reticulumBiogenesisBiologyChromosomal translocationCell biologyTransloconInsulinGeneticsEndocrinologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mechanistic basis for the biogenesis of peptide hormones and growth factors is poorly understood. Here we show that the conserved endoplasmic reticulum (ER) membrane translocon-associated protein (TRAP) α, also known as signal sequence receptor 1 (SSR1) 1 , plays a critical role in the biosynthesis of insulin. A genetic screen in the nematode Caenorhabditis elegans revealed trap-1 , which encodes the C. elegans TRAPα ortholog, as a modifier of DAF-2 insulin receptor (InsR) signaling. Genetic analysis indicates that TRAP-1 acts upstream of DAF-2/InsR to control C. elegans development. Endogenous C. elegans TRAP-1 and mammalian TRAPα both localized to the ER. In pancreatic beta cells, TRAPα deletion impaired preproinsulin translocation but did not affect the synthesis of α 1 -antitrypsin, indicating that TRAPα selectively influences the translocation of a subset of secreted proteins. Surprisingly, loss of TRAPα function also resulted in disruption of distal steps in insulin biogenesis including proinsulin processing and secretion. These results show that TRAPα assists in the ER translocation of preproinsulin and unveil unanticipated additional consequences of TRAPα loss-of-function on the intracellular trafficking and maturation of proinsulin. The association of common intronic single nucleotide variants in the human TRAPα gene with susceptibility to Type 2 diabetes and pancreatic beta cell dysfunction 2 suggests that impairment of preproinsulin translocation and proinsulin trafficking may contribute to the pathogenesis of Type 2 diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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