Molecular diversity of the 5S nuclear ribosomal DNA in<i>Campeiostachys</i>with<b>StHY</b>haplome constitution
Notice bibliographique
Résumé
Abstract To detect the genomic constitutions and investigate the evolutionary relationships betweenCampeiostachysDrobov andElymusL. species, we have cloned and analyzed 271 5S nuclear ribosomal DNA sequences from 27 accessions of these species, mostly of Chinese origin. We identified LongH1, ShortS1, and LongY1 unit classes in nineCampeiostachysorElymusspecies. The identification of the three orthologous unit classes was confirmed by the neighbor‐joining tree of each unit class from PAUP and the phylogeny tree of three unit classes from MrBayes. The results suggested that theseElymusspecies compriseStYHhaplomes and should be included inCampeiostachys. The phylogeny tree showed a clear separation between theS1 unit class andY1 unit class. However,Y1 unit class sequences formed a sister clade to theS1 unit class, implying that although theStandYhaplomes might have some affinity, they are distinct from one another. The phylogeny tree also indicated that the five species in sect.Turczaninovia(C. dahuricavar.cylindrica,C. dahuricavar.dahurica,C. dahuricavar.tangutorum,E. purpuraristatus, andE. dahuricusTurcz. ex Griseb. var.violeusC. P. Wang & H. L. Yang) might share a more recent common ancestor, whereas the four species in sect.Elymus(C. nutans,E. breviaristatus(Keng) Keng ex Keng f.,E. sinosubmuticus(Keng) Keng f., andE. atratus(Nevski) Hand.‐Mazz.) share a close relationship. By identifying only one type of unit class for each haplome, we propose that the 5S nuclear ribosomal DNA sequences of species withinCampeiostachysmight have undergone haplome‐specific concerted evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».