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Enregistrement W2913319515 · doi:10.1016/j.carj.2018.09.003

The Efficacy of Computed Tomography-Guided Percutaneous Spine Biopsies in Determining a Causative Organism in Cases of Suspected Infection: A Systematic Review

2019· review· en· W2913319515 sur OpenAlexaff
Madeleine Sertic, Leighanne Parkes, Sabrina Mattiassi, Kenneth P. H. Pritzker, Michael Gardam, Kieran J. Murphy

Notice bibliographique

RevueCanadian Association of Radiologists Journal · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfectious Diseases and Tuberculosis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineVertebral osteomyelitisBiopsyPercutaneousSpondylodiscitisRadiologyDiscitisOsteomyelitisSurgeryMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: In suspected spondylodiscitis and vertebral osteomyelitis, computed tomography (CT)-guided biopsies are often performed to determine a causative organism and guide antimicrobial therapy. The aim of this study is to determine the diagnostic culture yield of CT-guided biopsies performed in cases of suspected spinal infections. METHODS: A literature search of PubMed and MEDLINE up to April 2017 was performed for keywords "CT guided vertebral biopsy infection," "CT-guided spine biopsy infection," "CT guided spine biopsy yield," and "CT guided vertebral biopsy yield." Inclusion criteria primarily consisted of studies exclusively using CT-guided biopsies in cases of suspected infectious lesions only. After study selection, published articles were analysed to determine diagnostic culture yield. Descriptive statistics were applied. RESULTS: 220 search results were screened; 11 met our inclusion criteria and were reviewed. In total, 647 biopsies of suspected infectious spinal lesions were performed. Positive cultures were obtained in 241 cases. Upon excluding one paper's skewed results, the net pooled results culture yield was 33%. Several cultures grew multiple organisms, leading to a total of 244 species identified. Most common isolated organisms include Staphylococcus aureus (n = 83), coagulase-negative Staphylococcus (n = 45), and Mycobacteria (n = 38). CONCLUSIONS: The diagnostic culture yield of CT-guided biopsies in cases of suspected spinal infection is 33%. In the majority of cases, a causative organism is not identified. This suggests that improvements can be made in biopsy technique and specimen transfer to optimize culture yield and increase the clinical value of the procedure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,047
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,047
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,005
Bibliométrie0,0150,013
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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