Early stages of aggregation of engineered α-synuclein monomers and oligomers in solution
Notice bibliographique
Résumé
α-Synuclein is a protein that aggregates as amyloid fibrils in the brains of patients with Parkinson's disease and dementia with Lewy bodies. Small oligomers of α-synuclein are neurotoxic and are thought to be closely associated with disease. Whereas α-synuclein fibrillization and fibril morphologies have been studied extensively with various methods, the earliest stages of aggregation and the properties of oligomeric intermediates are less well understood because few methods are able to detect and characterize early-stage aggregates. We used fluorescence spectroscopy to investigate the early stages of aggregation by studying pairwise interactions between α-synuclein monomers, as well as between engineered tandem oligomers of various sizes (dimers, tetramers, and octamers). The hydrodynamic radii of these engineered α-synuclein species were first determined by fluorescence correlation spectroscopy and dynamic light scattering. The rate of pairwise aggregation between different species was then monitored using dual-color fluorescence cross-correlation spectroscopy, measuring the extent of association between species labelled with different dyes at various time points during the early aggregation process. The aggregation rate and extent increased with tandem oligomer size. Self-association of the tandem oligomers was found to be the preferred pathway to form larger aggregates: interactions between oligomers occurred faster and to a greater extent than interactions between oligomers and monomers, indicating that the oligomers were not as efficient in seeding further aggregation by addition of monomers. These results suggest that oligomer-oligomer interactions may play an important role in driving aggregation during its early stages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».