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Enregistrement W2913535980 · doi:10.1101/543017

Inhibitor of apoptosis, IAP, genes play a critical role in the survival of HIV-infected macrophages

2019· preprint· en· W2913535980 sur OpenAlexaff
Ashok Kumar, Ramon Edwin Caballero, Simon Xin Min Dong, Niranjala Gajanayaka, Hamza Ali, Edana Cassol, D. William Cameron, Robert G. Korneluk, Michel J. Tremblay, Jonathan B. Angel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversité LavalAgricultural Research Institute of OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApoptosisInhibitor of apoptosisDownregulation and upregulationCaspaseBiologyIn vivoEx vivoProgrammed cell deathCell biologyVirologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Latent viral reservoirs of HIV-1 that persist despite antiretroviral therapy (ART) are major barriers for a successful cure. Macrophages serve as viral reservoirs due to their resistance to apoptosis and HIV-cytopathic effects. We have previously shown that inhibitor of apoptosis proteins (IAPs) confer resistance to HIV-Vpr-induced apoptosis in normal macrophages. Herein, we show that second mitochondrial activator of caspases (SMAC)-mimetics (SM) specifically induce apoptosis of monocyte-derived macrophages (MDMs) infected in vitro with a R5-tropic laboratory strain expressing heat stable antigen, and GFP-expressing HIV, chronically infected U1 cells, and ex-vivo derived MDMs from naïve and ART-treated HIV patients. SM-induced cell death was found to be mediated by IAPs using IAP siRNAs, was independent of endogenously produced TNFα and was attributed to the concomitant downregulation of IAP-1/2 and the receptor interacting protein kinase-1 degradation following HIV infection. Altogether, modulation of the IAP pathways may be a potential strategy for selective killing of HIV-infected macrophages in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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