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Enregistrement W2913605727 · doi:10.1080/07060661.2019.1577300

Virulence of <i>Puccinia coronata</i> var <i>avenae</i> f. sp. <i>avenae</i> (oat crown rust) in Canada during 2010 to 2015

2019· article· en· W2913605727 sur OpenAlexaffvenueabout
J. G. Menzies, Allen Xue, Janet Gruenke, Rebecca Dueck, Sharon Deceuninck, Yuanhong Chen

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of ManitobaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceBiologyRust (programming language)PopulationCultivarRace (biology)Veterinary medicineGeneBotanyGeneticsDemographyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Crown rust, caused by Puccinia coronata var. avenae f. sp. avenae (Urban & Marková) (Pca), is an economically significant problem in oat in Canada. The growing of crown rust resistant oat cultivars has been an important management practice. The development of oat cultivars with effective resistance requires knowledge of the virulence genes present in the pathogen population. This study’s objective was to determine the presence and frequency of virulence to 24 oat lines with single Pc genes in isolates of Pca collected in Canada during 2010 to 2015. A total of 692 distinct races were identified, of which 603 were from the eastern Prairie region (EPR) and 89 from eastern Canada. None of the 24 Pc resistance genes studied was effective against all of the Pca isolates from the EPR. The frequency of virulence increased on 15 of the Pc differential lines in the EPR between 2010 and 2015, with the most dramatic increase from 0% to 67% being to Pc91. The most effective resistance genes were Pc94, Pc50, Pc96, Pc97, Pc98 and Pc101. Virulence to Pc58, Pc94, Pc98 and Pc101 was not observed in Pca isolates from eastern Canada. The race structure of the Pca population in Canada was highly variable, with more than 80% of the races identified each year represented by one Pca isolate. The race structure of the Pca populations in eastern Canada and the EPR were distinct, as 80% of the races identified from Pca isolates collected in eastern Canada were not detected in the EPR. The results of this study indicate that the Pca populations in the EPR and eastern Canada continue to evolve in their virulence dynamics, creating a challenge to breed oat lines with effective and stable resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil0,306

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,172
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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