Reductive Dehalogenation of Trichloromethane by Two Different <i>Dehalobacter restrictus</i> Strains Reveal Opposing Dual Element Isotope Effects
Notice bibliographique
Résumé
Trichloromethane (TCM) is a frequently detected and persistent groundwater contaminant. Recent studies have reported that two closely related Dehalobacter strains (UNSWDHB and CF) transform TCM to dichloromethane, with inconsistent carbon isotope effects (ε 13 C UNSWDHB = −4.3 ± 0.45‰; ε 13 C CF = −27.5 ± 0.9‰). This study uses dual element compound specific isotope analysis (C; Cl) to explore the underlying differences. TCM transformation experiments using strain CF revealed pronounced normal carbon and chlorine isotope effects (ε 13 C CF = −27.9 ± 1.7‰; ε 37 Cl CF = −4.2 ± 0.2‰). In contrast, small carbon and unprecedented inverse chlorine isotope effects were observed for strain UNSWDHB (ε 13 C UNSWDHB = −3.1 ± 0.5‰; ε 37 Cl UNSWDHB = 2.5 ± 0.3‰) leading to opposing dual element isotope slopes (λ CF = 6.64 ± 0.14 vs λ UNSWDHB = −1.20 ± 0.18). Isotope effects of strain CF were identical to experiments with TCM and Vitamin B 12 (ε 13 C Vitamin B12 = −26.0 ± 0.9‰, ε 37 Cl Vitamin B12 = −4.0 ± 0.2‰, λ Vitamin B12 = 6.46 ± 0.20). Comparison to previously reported isotope effects suggests outer-sphere-single-electron transfer or S N 2 as possible underlying mechanisms. Cell suspension and cell free extract experiments with strain UNSWDHB were both unable to unmask the intrinsic KIE of the reductive dehalogenase (TmrA) suggesting that enzyme binding and/or mass-transfer into the periplasm were rate-limiting. Nondirected intermolecular interactions of TCM with cellular material were ruled out as reason for the inverse isotope effect by gas/water and gas/hexadecane partitioning experiments indicating specific, yet uncharacterized interactions must be operating prior to catalysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».