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A new genomic blueprint of the human gut microbiota

2019· article· en· 1 385 citations· W2913972921 sur OpenAlex· 10.1038/s41586-019-0965-1

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants
0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

The composition of the human gut microbiota is linked to health and disease, but knowledge of individual microbial species is needed to decipher their biological roles. Despite extensive culturing and sequencing efforts, the complete bacterial repertoire of the human gut microbiota remains undefined. Here we identify 1,952 uncultured candidate bacterial species by reconstructing 92,143 metagenome-assembled genomes from 11,850 human gut microbiomes. These uncultured genomes substantially expand the known species repertoire of the collective human gut microbiota, with a 281% increase in phylogenetic diversity. Although the newly identified species are less prevalent in well-studied populations compared to reference isolate genomes, they improve classification of understudied African and South American samples by more than 200%. These candidate species encode hundreds of newly identified biosynthetic gene clusters and possess a distinctive functional capacity that might explain their elusive nature. Our work expands the known diversity of uncultured gut bacteria, which provides unprecedented resolution for taxonomic and functional characterization of the intestinal microbiota.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Nature
Thématique
Gut microbiota and health
Domaine
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens
Western University
Organismes subventionnaires
Biotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilEuropean Molecular Biology LaboratoryDirectorate for Biological SciencesNational Health and Medical Research CouncilEuropean CommissionState Government of VictoriaWellcome Trust
Mots-clés
BiologyMetagenomicsGenomeMicrobiomeHuman microbiomeGut floraEvolutionary biologyRepertoirePhylogenetic diversityBacterial genome sizePhylogenetic treePhylogeneticsGeneticsComputational biologyGene
Résumé présent dans OpenAlex
oui